Najčešći tretman hipoksije će se razlikovati, ovisno o pojedinom pacijentu i razlozima koji stoje iza njegove ili njezine hipoksije. Postoje različita stanja koja mogu dovesti do hipoksije, a svako od njih zahtijeva poseban plan liječenja. Jedno uobičajeno liječenje hipoksije koje se koristi za različite uzroke je davanje pacijentu velike količine kisika kako bi se razina u krvi vratila na normalu. Nakon toga će uslijediti individualizirani tretmani za temeljni uzrok hipoksije.
Hipoksija je stanje u kojem je tjelesni sustav lišen kisika tijekom duljeg vremenskog razdoblja. To može dovesti do smrti stanica u tom području, što često rezultira trajnim oštećenjem ili čak smrću. Najčešći tip hipoksije je moždana i to se događa kada osoba ne može udisati dovoljno kisika zbog drugih para ili plinova koji se nalaze u zraku, nedostatka dostupnog kisika na višim nadmorskim visinama ili nemogućnosti apsorbiranja kisika iz pluća zbog bolesti.
Kada pacijent pati od ovog stanja, najčešći tretman hipoksije je da mu se da dovoljno kisika kako bi se uspostavila ravnoteža tijela. Ako je stanje uzrokovano višim visinama ili nekim drugim privremenim uzrokom, ovo može biti jedini tretman koji je potreban ako se ne napravi daljnja šteta. Vjerojatno će se provesti testovi kako bi se potvrdila moždana aktivnost i provjerile ima li komplikacija. Često, ako postoji oštećenje mozga, ono može biti nepovratno.
Postoje i mnoga stanja koja mogu dovesti do hipoksije. Sve što može uzrokovati ograničenje pluća i probleme s disanjem povezano je s povećanim rizikom, uključujući astmu i rak pluća. Najčešći tretman hipoksije za plućna stanja je uklanjanje svih blokada kako bi pacijent mogao bolje disati, bilo lijekovima ili operacijom, a ponekad i priključivanje pacijenta na opskrbu kisikom kako bi se osiguralo da dobiva odgovarajuću količinu. U nekim teškim slučajevima može biti potreban ventilator.
Moždani udari su još jedan uzrok smanjene razine kisika. Najčešći tretman hipoksije u ovom slučaju je pronaći blokadu koja vodi do mozga i ukloniti je. Obično je začepljenje uzrokovano krvnim ugruškom ili stvrdnutim arterijama kroz koje krv više ne može učinkovito teći. Lijekovi za uklanjanje ugrušaka ponekad mogu otopiti ili razbiti ugrušak. Lijekovi kao što je aspirin također mogu pomoći u ublažavanju hipoksije izazvane moždanim udarom tako što razrjeđuju krv i dopuštaju joj slobodniji protok kroz uske arterije. Mora se provoditi naknadna skrb kako bi se došlo do korijena moždanog udara, koji je obično uzrokovan visokim kolesterolom ili visokim krvnim tlakom.