Na cijene etanola može utjecati niz različitih čimbenika. Ovo gorivo ovisi o poljoprivrednom proizvodu, obično kukuruzu ili šećeru, tako da cijena ovih osnovnih proizvoda može napraviti ogromnu razliku kada je u pitanju određivanje cijene goriva za etanol. Ostali čimbenici koji utječu na cijenu etanola uključuju troškove proizvodnje, troškove transporta, poreze ili tarife i subvencije. Neki od njih stvaraju pritisak na povećanje cijena, dok drugi rade na snižavanju cijena.
Da bismo razumjeli glavnu ulogu koju cijene poljoprivrednih proizvoda igraju u cijeni plina etanola, pomaže znati što utječe na cijene te robe. Uvjeti uzgoja kao što su bolesti, vremenske prilike i uvjeti tla imaju značajan utjecaj na cijenu. Zakon ponude i potražnje uči da ako potražnja ostane ista ili raste, a ponuda se smanjuje, trošak raste. Stoga, kada uvjeti smanje prinose usjeva, cijena raste. Tijekom boljih godina, cijene etanola mogu zapravo pasti.
Iako je cijena ovih osnovnih građevnih blokova etanola važna, oni nisu tako promjenjivi kao što mnogi misle. Kukuruz i šećer se često kupuju na ugovor, čime se izbjegavaju neke od dnevnih promjena cijena koje će se sigurno dogoditi. Stoga cijene etanola mogu ostati relativno stabilne čak i kada postoje velike promjene na tržištu roba. Kada se pregovaraju o novim ugovorima, vjerojatnije je da će se cijene etanola promijeniti zbog ažuriranih cijena roba.
Drugi važan čimbenik u određivanju cijena etanola su troškovi prijevoza. Etanol se mora transportirati u cisternama u vlakovima i kamionima jer je jako korozivan. Postoji vrlo malo cjevovoda koji su dizajnirani da nose takav materijal. Stoga, etanol ima svojstveno povećanje cijene u usporedbi s običnim benzinom i uljem.
Trošak prijevoza donekle je nadoknađen činjenicom da na mnogim mjestima postoje subvencije i porezne olakšice za etanol. Takvi poticaji postoje jer neke vlade žele potaknuti korištenje etanola kao čišćeg goriva. To pomaže sniziti cijene etanola, iako umjetno.
Međutim, ova umjetna kontrola cijena može funkcionirati u oba smjera. Tarife i drugi porezi na etanol također su umjetni utjecaji na cijenu i pomažu guranju cijene prema gore, posebno kada su u pitanju inozemni izvori etanola. Na primjer, brazilski etanol bio bi puno jeftiniji za kupnju u Sjedinjenim Državama, osim što postoji carina na njegov uvoz. To čini cijenu brazilskog etanola jednakom, ili čak skupljom, od domaćeg etanola. To možda neće biti od koristi za potrošače, ali pomaže u zaštiti domaće industrije.