Japanska mitologija prvenstveno se vrti oko šintoističke religije i uključuje tisuće bogova, božica i duhova. Zapravo, prema šintoističkim vjerovanjima, svaki predmet u prirodi, od najmanje stijene do najvećeg drveta, ima svoj duh; ovo može učiniti razumijevanje glavnih elemenata sustava vjerovanja malo neodoljivim za laike. Međutim, unatoč velikom broju božanstava u japanskoj mitologiji, nekoliko temeljnih božanstava igra veliku ulogu, uključujući Amaterasu, Hachiman i Susano.
U šintoističkoj religiji božanstva se nazivaju “kami”. Međutim, izraz je više od samo naziva za božanstva, on također predstavlja životnu snagu za koju se kaže da teče kroz svako biće i komadić prirode na svijetu. Nakon smrti, ljudski duhovi postaju kami, a u čast toga, najutjecajniji građani često bivaju pokopani u neko od brojnih svetišta koja se nalaze diljem Japana, kako bi pobožnosti vjernika doprle do njih.
Susano, kami oluja, neumitno je vezan za okoliš Japana. Japan je okružen vodom, a ponekad ta voda može biti posebno gruba, ustupajući mjesto snažnim tajfunima i masivnim tsunamijima. Japan u dijelu Pacifičkog vatrenog prstena, izraz koji se koristi za opisivanje područja sklona potresima i vulkanskim erupcijama. Smatra se da Susano malo brine o zemlji i njenim ljudima.
Amaterasu je kami sunca i plodnosti u japanskoj mitologiji i jedan od najvažnijih kamija. Ona igra veliku ulogu u stvaranju svjetla koje omogućuje da polja riže, jedne od primarnih japanskih kultura, rastu svake sezone. Njen unuk, Ninigi no Mikoto, navodno je djed Jimmua Tenna, prvog japanskog božanskog cara. Iako car više ne vlada Japanom, simbolična uloga kraljevske obitelji ostaje vrlo značajna za naciju.
Hachiman je prvenstveno kami rata i ratnika, ali ga obožavaju i oni koji rade u ribarstvu i poljoprivrednoj industriji. Samuraji, skupina visoko uvježbanih i žestoko odanih japanskih ratnika, traže zaštitu od Hachimana. On je jedno od najpopularnijih božanstava u Japanu, s tisućama svetišta posvećenih njemu diljem zemlje.
Japanska mitologija također sadrži brojne priče o zlim duhovima, a većina rituala koji se izvode u zemlji osmišljeni su kako bi spriječili te duhove da nanose štetu. Jedan popularan ritual događa se prije Nove godine, kada Japanci čiste svoje domove i metlom pometu zle duhove. Cedrovo lišće se također može postaviti iznad ulaza u japanski dom kako bi se držala podalje Amazake-babaa, starija žena koja donosi bolest svima koji se otvaraju na vrata kad ona pokuca.