Pilates je vrsta programa vježbanja koja može biti pomalo teška, posebno za početnike, pa je prilikom podučavanja pilatesa važno da instruktor uzme u obzir razine sposobnosti polaznika nastave. Kako biste olakšali ovo prepoznavanje razina sposobnosti, najbolje je ograničiti veličinu razreda prilikom podučavanja pilatesa kako bi svaki sudionik dobio više pažnje jedan na jedan. Razred bi trebao biti prilagođen određenoj razini sposobnosti; to će omogućiti grupiranje početnika s drugim početnicima, srednjih s drugim srednjim i stručnjaka s drugim stručnjacima.
Jedna od pogrešaka koju čine mnogi instruktori pilatesa je da ne ulažu dovoljno truda kako bi sat bio zabavan. Podučavanje pilatesa je više od pukog navođenja ljudi da pravilno vježbaju; radi se o podučavanju tih ljudi da dugoročno razviju zdrave navike. Jedan od načina da to učinite je da počnete podučavati pilates na način koji će aktivnost činiti zabavnom za sudionike; vjerojatnije je da će htjeti nastaviti raditi pilates ako se zabavljaju radeći to, a instruktor bi trebao poticati takve stavove. Suradnja sa sudionicima izvrstan je način za to, a važno je i osigurati da je svaka osoba unutar svoje razine sposobnosti, a da pritom još uvijek promiče zone udobnosti.
Naravno, učinkovitost bilo kojeg instruktora pilatesa ovisit će o njegovom ili njezinom poznavanju rutina vježbanja i njegovom ili njezinom entuzijazmu za pilates. Najbolji instruktori bit će entuzijastični i energični, jer će te osobine biti zarazne. Ljudi koji pohađaju tečaj shvatit će kako instruktor podučava pilates, a sudionici će odraziti taj entuzijazam. Instruktor bi, naravno, trebao znati pravilno i sigurno raditi sve vježbe, te bi trebao biti sposoban izvesti sve vježbe koje se podučavaju.
Instruktor mora biti jasan s uputama i napraviti glatke prijelaze između aktivnosti kada podučava pilates. To znači raditi na učinkovitom komunikaciji i osigurati da svaka osoba u razredu razumije upute. Između vježbi instruktor bi trebao ohrabrivati i motivirati sudionike ili pažljivo objašnjavati sljedeću aktivnost i zašto je važna. Ponavljanje će biti važno, jer mnogi ljudi isprva neće čuti niti razumjeti upute. Neki ljudi bolje uče gledajući, pa će instruktor morati demonstrirati vježbe pilatesa prije i tijekom seta vježbi koje sudionici izvode.