Sigurnost web sadržaja veliki je problem i za velike web stranice sa zamršenim sustavima sadržaja i baza podataka i za male web stranice s jednostavnim sučeljem Hypertext Markup Language (HTML). Jedna od prvih velikih stvari koje vlasnik web-mjesta mora razumjeti je da, čak i ako je web stranica mala i ne sadrži nikakve vrijedne informacije, i dalje može biti meta hakera. Vlasnik web-mjesta također bi trebao provjeriti da li web-mjesto ima pogrešaka u unosu, kao što su one koje korisnicima dopuštaju pisanje HTML-a ili drugog kodiranja u područja za unos. Ostala područja koja treba provjeriti kako biste osigurali sigurnost web sadržaja su postavke korisničkih dopuštenja i provjera valjanosti podataka. Također treba razumjeti phishing prijevare i suzdržati se od stavljanja osjetljivih informacija u kodiranje.
Mnogi vlasnici web stranica, i veliki i mali, obično vjeruju da imaju web stranicu koja neće biti hakirana ili nije vrijedna hakiranja. To vjerojatno vrijedi za većinu vlasnika web stranica, posebno za one koji posjeduju male web stranice i samo objavljuju informacije o svakodnevnom životu. Većina hakera napada velike web stranice jer imaju vrijedne informacije, ali drugi napadaju male web stranice samo iz zabave. Bez obzira na veličinu web-mjesta, može biti hakirano, pa bi vlasnik uvijek trebao misliti na sigurnost.
Mnoge web stranice imaju područje u koje gosti mogu unijeti podatke, kao što je odjeljak za komentare. Ako web stranica nema granice u pogledu vrijednosti koje se mogu unijeti ili dopušta pokretanje programskih jezika iz tih ulaza, virus se lako može staviti u ulaz. Na primjer, ako odjeljak za komentare korisnicima omogućuje pokretanje JavaScript®, tada haker može unijeti skriptu za krađu informacija o kolačićima web stranice. Kako bi zaštitio sigurnost web sadržaja, administrator mora postaviti ulaze kako bi spriječio aktiviranje programskih jezika.
Na web-stranici na kojoj radi više korisnika odjednom, sva korisnička dopuštenja trebaju biti postavljena na minimum. Ako korisnik treba samo pročitati neke informacije iz baze podataka, tada bi administrator trebao dopustiti samo ovu privilegiju i ništa drugo. Programi za autentifikaciju i provjeru valjanosti pomažu u sigurnosti, provjeravaju sve dolazne i odlazne informacije. Iako većina radnika neće ukrasti informacije, oni surađuju najbliži web stranici i lako mogu ugroziti sigurnost web sadržaja.
Prevare krađe identiteta mogu se koristiti za ulazak na web stranicu i prepisivanje ili brisanje cijelog web sadržaja. U phishing prijevari, haker će poslati e-poštu, predstavljajući se kao tvrtka kao što je tvrtka za hosting domene. U e-poruci će biti navedeno da su domaćinu potrebne osjetljive informacije, kao što je administratorska lozinka webmastera. Administratori nikada ne bi smjeli odavati osjetljive informacije u e-poruci, jer će to gotovo sigurno dovesti do sigurnosnih problema web sadržaja.
U mnogim programskim jezicima postoji oznaka koja programeru omogućuje pisanje bilješke. Ove bilješke su obično nešto maleno, kao što su detalji o tome što funkcija radi, ali druge bilješke su opasne. Neki novi programeri mogu ostaviti lozinku u kodu, koju svatko može pročitati. Administratori i programeri trebali bi provjeriti ima li ovakvih osjetljivih informacija i trebali bi ih odmah izbrisati iz koda.