Krumpir treba pažljivo čuvati kako se ne bi pokvario. Općenito, treba ih čuvati na hladnom i tamnom mjestu. Prilikom skladištenja krumpira također treba paziti da zrak slobodno cirkulira oko njega i da je suh. Izrezani ili oguljeni krumpir mogu se kratko čuvati u hladnoj vodi, a pripremljena jela od krumpira mogu se zamrznuti.
Nepravilno uskladišteni krumpir može niknuti, pozeleniti ili postati mekan i naboran. Općenito, krumpir se može čuvati otprilike tjedan dana na sobnoj temperaturi. Nakon tog vremena, često će se početi pokvariti. Skladišteni krumpir treba redovito provjeravati, a sve koji su počeli omekšavati, razvijati plijesan ili mekane mrlje treba ukloniti.
Hladno mjesto najbolje je za skladištenje krumpira dulje od tjedan dana. Topli zrak, iznad 50° F (10° C), može dovesti do nicanja. Podrum s korijenom obično je savršeno mjesto za pohranu krumpira, ali i hladni podrum ili garaža također će raditi. Neki ih čak radije čuvaju u hladnjaku, ali to može malo promijeniti okus i boju krumpira.
Prostor u kojem osoba čuva krumpir također bi trebao biti taman. Kada je krumpir izložen svjetlu, osobito sunčevoj svjetlosti, počinje proizvoditi klorofil. To može rezultirati svijetlozelenim mrljama na krumpiru. Klorofil može učiniti krumpir gorkim okusom, a može biti i otrovan u vrlo velikim količinama.
Za skladištenje krumpira mogu se koristiti neprozirne posude, ako tamna mrlja nije dostupna. Međutim, ove posude treba dobro prozračiti kako bi se osiguralo da zrak cirkulira oko njih. Spremnici za krumpir ne bi trebali imati hermetičku brtvu, jer to može zadržati vlagu. Ova zarobljena vlaga može uzrokovati da krumpir postane mekan i naboran, te može potaknuti rast plijesni. Krumpir se također nikada ne smije čuvati nakon što se opere, jer može biti vlažan. Pojedinci bi trebali pričekati dok krumpir nije spreman za kuhanje prije nego što ga operu.
Izrezani ili oguljeni krumpiri često će brzo posmeđiti ako se ubrzo ne skuhaju. Kako bi spriječili da meso krumpira posmeđi, izrezani krumpir možete čuvati u posudi s hladnom vodom. U vodu se može dodati led da ostane hladna ili se posuda može čuvati u hladnjaku. Hladna voda obično će zadržati meso krumpira bijelim nekoliko sati.
Općenito se ne preporučuje zamrzavanje krumpira koji nije kuhan. Kuhani ili blanširani krumpir, međutim, obično se vrlo dobro zamrzne. Jela od krumpira, poput pirea ili prženog krumpira, mogu se napraviti unaprijed i čuvati u zamrzivaču.