Riješiti se čira u ustima nije uvijek moguće. Zapravo, prema mnogim stručnjacima, jedini način da se riješite čira u ustima u većini slučajeva je da ih pustite da zacijele sami. Ponekad je moguće smanjiti jačinu čira u ustima primjenom antihistaminika, a bol je moguće nositi s proizvodima koji umrtvljuju usta. U nekim slučajevima, čirevi u ustima mogu biti znak ozbiljne bolesti poput raka usta, a čirevi u ustima iz tih izvora možda uopće neće zacijeliti bez drastičnih mjera liječenja.
Proces rješavanja čira u ustima općenito je kompliciran činjenicom da postoji mnogo različitih mogućih uzroka. Na primjer, čireve u ustima potencijalno mogu uzrokovati virus herpesa, rak i bakterijske infekcije. Osim toga, jedan od najčešćih tipova čira u ustima je afta, a o stvarnom uzroku se još uvijek raspravlja. Za većinu uobičajenih uzroka čira u ustima ne postoje tretmani za koje je zajamčeno djelotvorno – međutim, preventivne mjere postoje.
Mnogi stručnjaci vjeruju da se neke čireve u ustima mogu spriječiti korištenjem najbolje moguće oralne higijene. To bi općenito uključivalo redovito pranje zubi uz čišćenje koncem i korištenje vode za ispiranje usta. Ponekad ljudi također mogu ubrzati proces rješavanja čira u ustima korištenjem antibakterijskih vodica za ispiranje usta, ali to je općenito korisno samo ako su čirevi povezani s bakterijskom infekcijom. Stručnjaci su također identificirali moguću povezanost između nekih čira u ustima i upotrebe zubnih pasta koje sadrže kemikaliju nazvanu natrijev lauril sulfat, pa neki oboljeli odlučuju izbjegavati robne marke s tom kemikalijom.
Većina lijekova protiv čira u ustima koji se izdaju bez recepta zapravo nisu korisni kao lijekove. Uglavnom se usredotočuju na rješavanje simptoma. Uobičajeni pristup je zaštititi čir nekom vrstom prevlake uz istovremeno otupljivanje područja kako bi se riješio bol. Mnogi ljudi koji pate od čira u ustima tvrde da ova kombinacija tretmana dobro rješava nelagodu.
Većina čireva u ustima općenito će nestati unutar nekoliko tjedana sami, a ponekad i mnogo prije. Liječnici obično sugeriraju da bi ljudi trebali postati zabrinuti ako čirevi u ustima traju dulje od 21 dan. To bi mogao biti znak da je čir u ustima uzrokovan rakom ili nekim drugim potencijalno ozbiljnim problemom.