Nakon vazektomije, neki muškarci prijavljuju uobičajene probleme kao što su modrice u blizini mjesta reza, oteklina i manja nelagoda. Ovi problemi vazektomije su očekivani i općenito traju samo nekoliko dana. U nekim slučajevima mogu se pojaviti ozbiljnije komplikacije, uključujući infekciju nakon operacije.
Gotovo svaki pacijent osjetit će nekoliko problema s vazektomijom u danima ili tjednu neposredno nakon zahvata, uključujući modrice i oticanje testisa, kao i određenu bol i nelagodu. Uobičajena je praksa da liječnik prepiše oralne lijekove protiv bolova i eventualno protuupalne lijekove za ublažavanje ovih simptoma. Mnogi pacijenti smatraju korisnim na kratko vrijeme nanositi vrećicu leda na to područje kako bi ograničili cirkulaciju krvi i ublažili bol. Nakon vazektomije, pacijentima se obično daje uputa da odmah obavijeste liječnika ako se pojave ozbiljnije komplikacije vazektomije, poput groznice ili stvaranja kvržica u testisima.
Postoje i drugi ozbiljniji problemi vazektomije koji se mogu manifestirati nakon operacije kao što su groznica, infekcija i stanje poznato kao granulomi sperme, što se odnosi na stražnju kopiju sperme u testisima. U slučaju bilo kojeg od ovih stanja, važno je da pacijent što prije zatraži liječnički savjet od svog liječnika. Groznica se najčešće može liječiti kod kuće lijekovima bez recepta i mirovanjem, ali ako je prisutna infekcija, liječnik će htjeti pregledati područje i postupiti u skladu s tim. Neobično je da granulomi sperme stvaraju probleme, a većina grudica će se sama otopiti u roku od godinu dana.
Nekoliko studija uvelo je ideju povezivanja vazektomije i većeg rizika od raka prostate za pacijente koji se odluče za ovaj postupak. Većina medicinskih stručnjaka vjeruje da nema veze između podvrgavanja vazektomiji i povećane stope raka prostate. Predlaže se da svaki muškarac redovito posjećuje liječnika radi pregleda prostate kako bi se osiguralo dobro zdravlje.
Iako je rijedak, neuspjeh vazektomije je problem za mali broj pacijenata. Uzrok ovih vrsta problema vazektomije često je nepoznat, a također je dio razloga zašto se pacijentima savjetuje korištenje alternativnih oblika kontracepcije prva tri mjeseca nakon zahvata. Sve dok se pacijentica pridržava zatraženog rasporeda uzorkovanja sperme, ovaj se problem može riješiti prije nego što dođe do bilo kakve neplanirane trudnoće.