Mješovita ekonomija je mješavina državno kontrolirane i slobodnog tržišta, i iako neki ovo gospodarstvo smatraju idealnim, ono ima nedostatke. Jedan od nedostataka mješovitog gospodarstva je to što vlasnici poduzeća moraju plaćati poreze koje ne mogu kontrolirati, jer vlada kontrolira naplatu i potrošnju poreza. Vlada ima tendenciju izdvajanja sredstava za socijalnu skrb, a ne za stavke koje bi potaknule gospodarstvo. Ova ekonomija vlasnicima poduzeća daje veliku slobodu, ali to nekima može predstavljati problem, jer vlasnici poduzeća moraju pronaći svoje tržište. Vlada također ima veliku ulogu u gospodarstvu, tako da vlasnici poduzeća obično moraju proći kroz puno papirologije i birokracije.
Vlasnici poduzeća rijetko vole plaćati poreze, jer im to zagriza zaradu. To je jedan od nedostataka mješovitog gospodarstva zbog načina na koji je država uključena u gospodarstvo. Vlasnici poduzeća također ne mogu odrediti kamo ide njihov novac od poreza. Umjesto toga, vlada uzima unaprijed određen postotak od dobiti vlasnika poduzeća i koristi novac kako želi; to znači da bi se novac mogao koristiti za socijalne programe ili za ratove.
Vlada ima kontrolu nad raspodjelom resursa u mješovitoj ekonomiji. U ekonomiji slobodnog tržišta sredstva će se dati uslugama koje najbolje potiču gospodarstvo, ali mješovito gospodarstvo daje većinu sredstava programima socijalne skrbi. Dok će neki ljudi to vidjeti kao prednost, to je nedostatak za vlasnike poduzeća, jer možda neće dobiti dovoljno resursa za stvaranje odgovarajućeg proizvoda ili profita.
Drugi nedostatak je količina slobode koju vlasnici poduzeća imaju da kreiraju proizvod. Iako postoje zakonska ograničenja za neke vrste proizvoda, većina proizvoda može se izraditi bez ikakvih problema. To znači da vlasnici poduzeća moraju pronaći i stvoriti svoje vlastito tržište, što nekim tvrtkama može biti teško zbog strane mješovitog gospodarstva na slobodnom tržištu.
Državne agencije obično vole pratiti poslovanje, njihovu zaradu i mnoge druge aspekte svoje poslovne prakse. To znači da će se vlasnici poduzeća možda morati nositi s puno papirologije i birokracije kako bi dobili licence ili jednostavno radili legalno. To je jedan od nedostataka mješovitog gospodarstva koji je najteži za privatne poduzetnike, jer često imaju najviše papirologije.