Kada se raspravlja o virtualnim privatnim mrežama (VPN-ovima), puno se vremena troši na hvaljenje njihovih prednosti. Kao takvi, mnogi pojedinci koji su im novi mogu se osjećati neinformiranima o nedostacima koji su svojstveni tehnologiji. Postoje neke zamke zajedničke VPN-ovima, ali mnogi ljudi smatraju da su značajne prednosti ovih mreža vrijedne truda da se nose s njihovim potencijalnim poteškoćama.
Jedan nedostatak VPN-a je činjenica da njegova implementacija zahtijeva visoku razinu znanja i razumijevanja čimbenika kao što je sigurnost javne mreže. VPN sigurnost zahtijeva šifriranje lozinke i podataka. Mrežne adrese također mogu biti šifrirane radi dodatne sigurnosti. Kako biste izbjegli probleme sa sigurnošću i implementacijom, potrebno je planiranje i poduzeti odgovarajuće mjere opreza.
Drugi značajan nedostatak je što je njegovu dostupnost i performanse teško kontrolirati. Obično su brzine VPN-a mnogo sporije od onih s tradicionalnom vezom. Ponekad se čini da su neke mreže pomalo oštre u pogledu povezivanja. Iz raznih razloga, korisnicima je s vremena na vrijeme teško ostati na VPN-u. Iako ovo može biti neugodno, sigurnost koju nudi često nadmašuje tugu uzrokovanu povremenim problemima s vezom.
Iako je istina da VPN radi s opremom mnogih različitih proizvođača, tehnologije različitih kreatora mogu loše funkcionirati zajedno. S vremenom se to može poboljšati. Međutim, za sada to može uzrokovati frustraciju prilikom implementacije VPN-a.
Jedna od najslabijih karika VPN-a mogu, u nekim slučajevima, biti njegovi korisnici. Kada se udaljeni daljinski radnik ili zaposlenik poveže sa svojim poslovnim uredom pomoću VPN-a s prijenosnog ili kućnog računala, mogu doći do sigurnosnih prijetnji. To je zato što zaposlenici ili zaposlenici na daljinu mogu koristiti svoja osobna računala za niz drugih aplikacija uz povezivanje s uredom. Kao takva, korporativna mreža može biti ranjiva na napade zbog sigurnosnih slabosti na osobnom računalu zaposlenika. Iz tog razloga, neki stručnjaci preporučuju opskrbu daljinskih radnika i zaposlenika kućnim računalima koja su u vlasništvu tvrtke i koja se koriste isključivo u odobrene svrhe tvrtke.