Hipotalamus ima tri dijela: prednji, tuberalni i stražnji. Svaki dio igra svoju ulogu u ukupnim funkcijama i odgovornostima endokrinog sustava. Opće odgovornosti uključuju spajanje endokrinog sustava i živčanog sustava. Ono što je najvažnije, ovaj mali dio mozga održava homeostazu, što je održavanje prikladnih uvjeta potrebnih tijelu za pravilno funkcioniranje.
Iako je hipotalamus mali organ u mozgu, ima velike zadaće za obavljanje. Oblikovan je kao stožac i nalazi se iznad moždanog debla, ispod talamusa. Ovaj dio se proteže prema dolje dok se ne susreće s infundibularnom peteljkom, koja je cijev koja je spojena s hipofizom. Općenito, ovaj organ ima više funkcija koje su podijeljene u svaki od tri dijela.
Zbog načina na koji je hipotalamus povezan s više područja središnjeg živčanog sustava i limbičkog prednjeg mozga, mora se prilagođavati prema različitim signalima, unutarnjim i vanjskim. Mirisna stimulacija često utječe na endokrine hormone. Glukortikoidi i steroidi utječu na reakcije kao što su apetit ili žeđ. Izloženost dnevnom svjetlu očit je signal; pomaže u regulaciji ciklusa spavanja i buđenja.
Prednja regija hipotalamusa nalazi se sprijeda i odgovorna je za nekoliko funkcija. To je ključni dio termoregulacije, a to je regulacija tjelesne temperature. Termoregulacija se kontrolira znojenjem i dahtanjem. Spavanje i cirkadijalni ciklusi također su regulirani prednjom regijom.
U sredini hipotalamusa nalazi se tuberalna regija. Ovaj dio je zadužen za žeđ i glad. Tuberalna regija također kontrolira krvni tlak i broj otkucaja srca. Ova regija također regulira hormone koji reguliraju rast i proizvodnju dopamina.
Na stražnjoj strani hipotalamusa nalazi se stražnja regija. Ovo područje kontrolira povećanje krvnog tlaka, drhtavicu i proširenje zjenica. Ova regija također utječe na memorijske funkcije.
U cjelini, hipotalamus kontrolira mnoge važne tjelesne funkcije. Neurohormone kontrolira i oslobađa ovaj mali organ u mozgu. Preko ovih hormona kontrolira se aktivnost hipofize, kao i metabolički procesi cijelog autonomnog živčanog sustava.
Osim hormona i kontrole metaboličkih aspekata, hipotalamus također kontrolira i oslobađa hormone koji utječu na endokrini sustav. Endokrini hormoni šalju se u hipofizu i igraju ulogu u određenim ponašanjima koja se temelje na emocijama, kao što su ljutnja, tjeskoba ili strah, te seksualne aktivnosti.