Postoji šest glavnih genotipova hepatitisa C, nazvanih 1, 2, 3, 4, 5 i 6. Hepatitis C je bolest koja se prenosi krvlju uzrokovana virusom hepatičnog C (HCV). Virus napada jetru, često bez simptoma dugi niz godina, i na kraju može uzrokovati infekciju jetre, ožiljke i na kraju otkaz. Međutim, svi genotipovi hepatitisa C mogu se liječiti liječenjem, iako se točne indikacije mogu mijenjati ovisno o genotipu i podtipu. Hepatitis C genotipovi 1, 2 i 3 su najčešći, a 2 i 3 imaju najuspješnije stope izlječenja.
Virus hepatitisa C prenosi se intravenskom primjenom droga; seks; transfuzije krvi i transplantacije organa prije nego što je bio potreban probir na HCV; prljavi instrumenti za medicinsku upotrebu, piercing ili tetoviranje; ili u maternici od majke do djeteta. Prvi šesti mjesec nakon infekcije nazivamo akutnom fazom i period je kada je bolest najizlječivija. Većina ljudi, međutim, tijekom tog vremena ne osjeti nikakve simptome i ne oboli od bolesti sve dok se ne razvije u kroničnu fazu i ne počne stvarati ožiljke na jetri. Simptomi tijekom akutne faze oponašaju simptome blage gripe, a kronični hepatitis C mogu se okarakterizirati žuticom, mučninom, smanjenim apetitom, umorom, bolovima u zglobovima, promjenama raspoloženja i problemima sa spavanjem. Kako bolest napreduje do ciroze ili opsežnih ožiljaka, može uzrokovati proširenje vena ili proširene vene, nakupljanje tekućine u trbuhu ili ascites, zastoj u radu jetre i zbunjenost ili komu.
Virus hepatitisa C je vrlo mali RNA virus, ili virus koji koristi RNK kao svoj genetski materijal. Različiti genotipovi dijele isti osnovni oblik virusa, s RNA iznutra i vanjskim slojem sastavljenim od proteina i enzima, što omogućuje virusu da otme stanice jetre kako bi se reproducirali.
Međutim, različiti genotipovi hepatitisa C imaju neznatno različitu genetsku strukturu, što omogućuje virusu da izbjegne pokušaje znanstvenika da razviju cjepivo koje će djelovati protiv svih genotipova hepatitisa C i mnogih podtipova. Iako genotip može odrediti trajanje liječenja i vjerojatnost uspjeha, ne smatra se da određuje opseg oštećenja jetre. Neke studije su također pokazale da različiti genotipovi mogu različito reagirati na različite vrste liječenja interferonom.
Hepatitis C genotipovi 1, 2 i 3 najčešći su genotipovi, osobito u Sjedinjenim Državama. HCV 1 ima dva podtipa, 1a i 1b. 1a je najčešći tip hepatitisa C u Sjevernoj i Južnoj Americi, a 1b je najčešći tip u Europi i Aziji. Teže ga je liječiti od genotipova 2 ili 3 i obično se liječi većim dozama ribavirina ili interferona dulje vrijeme. Genotip 2 ima tri podtipa, 2a, koji je zajednički za Kinu i Japan, 2b, koji je zajednički za Sjedinjene Države i Sjevernu Europu, i 2c, koji je zajednički za Južnu i Zapadnu Europu. Genotip 3 je najčešći u južnom Pacifiku. Oba genotipa hepatitisa C 2 i 3 imaju kraće razdoblje liječenja, obično oko šest mjeseci, niže doze ribavirina ili interferona i veće stope izlječenja.