U holističkim sustavima iscjeljivanja nadahnutim hinduizmom, čakre se smatraju vrtlozima energije. Kao što je uobičajeno s drevnim tradicijama, razvile su se varijacije modela sustava čakri. Neke varijacije su zapadnjačka tradicija, Bön i tantrički sustavi čakri. Kineska medicina također uključuje energetske centre koji su slični čakrama.
Većina sustava čakri ima sedam glavnih čakri, koje počinju u podnožju kralježnice i kreću se prema gore do vrha glave. Kada se definiraju čakre, ovih sedam se nazivaju korijenska, sakralna, solarni pleksus, srčana, grlena, treće oko i krunska čakra, što može odgovarati nakupinama živaca u tijelu. Ova energija može zahtijevati balansiranje čakri ili tehnike iscjeljivanja čakri za održavanje dobrog zdravlja.
Zapadnjačka misao o sustavima čakri bila je pod snažnim utjecajem prijevoda i radova Sir Johna Woodruffa i CW Leadbettera. U zapadnoj tradiciji, hinduistički koncepti čakri pomiješani su s tradicionalnim razumijevanjem kineske medicine o qi-u, odnosno životnoj energiji. Kao što je to slučaj s mnogim drugim tradicijama, u zapadnoj tradiciji čakre se nižu od baze kralježnice do tjemena na glavi. Izvodi New Agea obično povezuju boju sa svakom čakrom, zajedno s drugim fizičkim, mentalnim i emocionalnim karakteristikama. Neke varijante ispovijedaju postojanje čakre ispod stopala, poznate kao čakra zvijezda Zemlje, i jedne ili više čakri iznad glave, poznate kao transpersonalne čakre.
Himalijanska Bönpo tradicija, koju podučavaju Tenzin i Wangyal Rinpoche, zove se Bön. U Bön tradiciji postoji šest glavnih čakri. Bön čakre odgovaraju budističkim šest područja iskustva. Jedan ključni koncept u ovoj praksi je da će čakre, koje su centri životne snage, utjecati na karakter percipirane stvarnosti.
Hinduističke tradicije tantričke čakre često se povezuju s osjetilnošću i seksualnošću. Kundalini yoga se može koristiti u tantričkim praksama iscjeljivanja. Praktičari zamišljaju zmiju energije koja je smotana blizu donjeg dijela kralježnice. Određene joga poze mogu se koristiti u liječenju čakri uzrokujući da se zmija odmota. Ova akcija može pokrenuti transformaciju u kojoj su sve čakre, od korijena do krune, probušene, a svijest pojedinca se stapa s onom u svemiru.
Slično sustavima čakri, ideja energetskih centara također se koristi u kineskoj medicini. Životna energija kreće se niz kanal blizu prednjeg dijela tijela i prema gore duž kanala blizu stražnjeg dijela. Kao što vrijedi i za hinduističke sustave iscjeljivanja čakri, energija mora slobodno teći kako bi se održalo zdravlje.