Funkcionalne ciste jajnika uobičajeno su stanje za mnoge zdrave žene s menstruacijom, a obično su benigne. Mnoge žene, naime, i ne shvaćaju da ih imaju, jer su često asimptomatske. Međutim, postoje slučajevi kada cista može postati toliko velika da njezini zidovi oslabe, uzrokujući tako da pukne. Simptome rupture ciste jajnika može biti teško identificirati, jer opća bol povezana s cistom koja nije puknula može biti slična onoj kod rupturirane ciste. U drugim slučajevima, bol u području zdjelice može biti oštar i jak, a može postojati i osjećaj pritiska u donjem dijelu trbuha; također mogu biti prisutni neredoviti menstrualni ciklusi ili neuobičajene mrlje, mučnina i povraćanje.
Iako su ciste na jajnicima često prisutne bez simptoma, neke žene smatraju da stvaraju blagu, ali mučnu nelagodu – osobito prije i neposredno nakon menstrualnog ciklusa. To vrijedi i za rupturiranu izraslinu, iako puknuta cista jajnika može uzrokovati intenzivniju, peckajuću ili ubodnu bol u zdjelici koja se može proširiti na donji dio leđa. Ova bol može postati osobito uočljiva tijekom ili nakon spolnog odnosa, tijekom obavljanja svakodnevnih fizičkih aktivnosti ili vježbanja, ili tijekom pražnjenja crijeva ili mokrenja. Osim boli, donji dio trbuha se može rastegnuti, što može stvoriti osjećaj pritiska u tom području, koje je općenito osjetljivo na dodir.
Simptomi rupture ciste jajnika često će ometati menstrualni ciklus, ali mogu se uvelike razlikovati od osobe do osobe. Većina žena primijetit će nepravilnosti u svom menstrualnom ciklusu, što može promijeniti trajanje mjesečnice ili datume na koje se javlja, ili im menstruacija može potpuno prestati. U nekim slučajevima, količina krvarenja može se značajno povećati ili smanjiti.
Osim boli i nepravilnog menstrualnog ciklusa, drugi simptomi mogu uključivati oticanje ili osjetljivost dojki, probavne smetnje ili plinove, proljev ili zatvor, čestu potrebu za mokrenjem, gubitak apetita, blijedu kožu, slabost, povraćanje i vrtoglavicu. Ovi simptomi mogu ukazivati na infekciju ili unutarnje krvarenje. Svatko tko osjeti ove simptome trebao bi se liječiti od strane medicinskog stručnjaka što je prije moguće.
U mnogim slučajevima, intaktne ciste jajnika će se riješiti same; međutim, žene koje vjeruju da imaju rupturiranu cistu jajnika trebaju potražiti liječničku pomoć, jer komplikacije mogu postati opasne po život. Ovisno o težini slučaja, mnogi će medicinski stručnjaci pokušati stabilizirati stanje pacijenta, a potom problem liječiti antibioticima. Ako se pojave komplikacije, možda će biti potrebna kirurška intervencija.