Liječenje genitalnih bradavica u trudnoći često je malo drugačije od tretmana koji se koriste za osobe koje nisu trudne. Neki lijekovi možda nisu sigurni za primjenu na ili unutar vagine kada je žena trudna. Umjesto toga, liječnici mogu preporučiti takve tretmane kao što je zamrzavanje genitalnih bradavica, što se naziva krioterapija, ili lasersko uklanjanje. Liječnici također mogu preporučiti liječenje lokalnim lijekom koji se zove triklorooctena kiselina (TCA). Mnogi drugi uobičajeno korišteni lokalni tretmani su zabranjeni jer mogu naštetiti nerođenom djetetu žene.
Jedna od najčešće korištenih metoda liječenja genitalnih bradavica tijekom trudnoće je krioterapija. Ovaj tretman uključuje primjenu tekućeg dušika na genitalne bradavice. Genitalne bradavice se zamrzavaju, a zatim se postupno odmrzavaju. Nakon tretmana, tkivo koje čini genitalne bradavice postupno odumire i otpada. U mnogim slučajevima, međutim, jedan tretman krioterapije nije dovoljan da biste se riješili genitalnih bradavica; često su potrebni ponovljeni tretmani.
Lasersko uklanjanje također je među najčešćim tretmanima genitalnih bradavica u trudnoći. Za ovaj tretman, intenzivno svjetlo je koncentrirano na bradavice. To uništava tkivo bradavica, a da pritom ne šteti bebi u razvoju. U većini slučajeva lasersko uklanjanje genitalnih bradavica može se postići bez oštećenja okolnih tjelesnih tkiva i može uzrokovati manje boli od krioterapije. Međutim, može se pokazati kao skuplja opcija i postoji šansa da se tkivo bradavice na kraju vrati.
TCA je topikalni tretman koji se također koristi za genitalne bradavice u trudnoći. Mnogi drugi lokalni tretmani ne koriste se tijekom trudnoće jer mogu biti opasni za nerođeno dijete. Nažalost, neki lokalni lijekovi mogu se apsorbirati kroz kožu i uzrokovati urođene mane.
Međutim, liječenje genitalnih bradavica ne uklanja virus koji ih uzrokuje. To znači da su tretmani usmjereni na uklanjanje tkiva bradavica, a ne na liječenje genitalnih bradavica. Virus može na kraju uzrokovati nove bradavice i prenijeti se na drugu osobu.
Neke žene mogu odlučiti pričekati dok ne rode umjesto da se odluče za liječenje genitalnih bradavica u trudnoći. U nekim slučajevima to može dobro funkcionirati. Kod drugih, međutim, genitalne bradavice mogu postati dovoljno velike da ometaju kretanje djeteta kroz porođajni kanal ili mogu uzrokovati prekomjerno krvarenje. U tom slučaju liječnik može umjesto toga preporučiti carski rez.