Niska bazalna tjelesna temperatura obično je očitanje ispod oko 96°F (35.6°C). Temperaturu treba mjeriti u mirovanju, neposredno nakon buđenja, kako bi bila točna. Rezultat ukazuje na brzinu metabolizma osobe, pa niska tjelesna temperatura može signalizirati hipotireozu, što često rezultira nuspojavama koje uključuju suhu kožu, depresiju i umor. Za većinu žena, međutim, to se smatra normalnim barem dio mjeseca, jer tijelo obično ima nižu temperaturu prije ovulacije kao dio dvofaznog obrasca. To se obično događa tijekom menstruacije – u tom se slučaju može reći da tipični učinci niske temperature uključuju vaginalno krvarenje, umor i promjene raspoloženja – iako je niska temperatura više učinak hormonalnih promjena nego stanje koje uzrokuje druge učinke.
Neki ljudi redovito prate svoju bazalnu tjelesnu temperaturu, obično koristeći termometar svako jutro prije ustajanja iz kreveta. Mjerenje temperature u isto vrijeme svaki dan obično daje najtočnije rezultate, a većina medicinskih stručnjaka savjetuje da pacijenti bilježe temperaturu najmanje tri dana zaredom kako bi primijetili uzorak. To je zato što nasumična niska temperatura možda ne znači puno, ili može biti posljedica posebno hladne noći, ali temperature koje su stalno niže od prosjeka mogu signalizirati zdravstveni problem. Na primjer, budući da je brzina metabolizma određena brojem hormona koje štitna žlijezda oslobađa, niska bazalna tjelesna temperatura može ukazivati na hipotireozu.
Nedovoljna aktivnost štitnjače uzrokuje niz simptoma, ali mnogi ljudi ostaju nedijagnosticirani jer se učinci često pripisuju drugim problemima. Na primjer, mnogi pacijenti se žale na glavobolju, suhu kožu, depresiju, umor, debljanje i osjetljivost na hladnoću. Žene s hipotireozom također mogu primijetiti nepravilne menstrualne cikluse. Ako se ovo stanje ne liječi godinama, pacijenti mogu patiti od usporenog govora, debele kože i nemogućnosti okusa ili mirisa jednako učinkovito kao i obično.
Za mnoge žene, međutim, niska bazalna tjelesna temperatura je normalna sve dok traje samo oko pola mjeseca. To je zato što menstrualni ciklus koristi dvofazni obrazac u kojem je tjelesna temperatura niska prva dva tjedna ciklusa i viša tijekom druge polovice. Visoka razina estrogena obično je krivac prije ovulacije, zbog čega se temperatura povećava neposredno nakon ovulacije tijela, kada progesteron preuzme. Stoga niska temperatura može biti popraćena i vaginalnim krvarenjem i simptomima predmenstrualnog sindroma (PMS), kao što su umor, promjene raspoloženja i nadutost.