Učinci organizacijske strukture mogu se protegnuti na gotovo svaku vrstu mjerljive izvedbe. Dobro planirana, lako prilagodljiva struktura može pomoći poslovanju da napreduje u mnogim područjima, stvarajući lančanu reakciju međusobne podrške i poboljšanja. Neki od najvažnijih učinaka organizacijske strukture mogu se vidjeti u moralu zaposlenika, internoj komunikaciji, učinkovitosti i djelotvornosti.
Moral zaposlenika često se uvelike oslanja na snažnu organizacijsku strukturu. Zaposlenici se obično osjećaju motiviranima i lojalnima kada se prema njima postupa s poštovanjem, kada ih njihov rad izaziva i kada imaju pristup mogućnostima napredovanja. Učinci organizacijske strukture na moral zaposlenika također mogu biti negativni; ako, na primjer, organizacija rutinski nagrađuje voditelje odjela povišicama i bonusima dok zamrzava plaće mlađih zaposlenika, zaposlenici na nižim razinama mogu brzo postati razočarani poslom. Budući da dio organizacijske strukture određuje kako se upravlja programima poticaja, disciplini i napredovanju, način na koji je posao organiziran može igrati vrlo stvarnu ulogu u stanju morala.
Koliko dobro zaposlenici i odjeli mogu komunicirati je još jedan od najvažnijih učinaka organizacijske strukture. U kruto strukturiranom, visoko odvojenom okruženju, zaposlenici možda neće moći pristupiti informacijama ili osoblju potrebnom za obavljanje zadatka. S druge strane, previše labava organizacija može dovesti do nejasnog lanca zapovijedanja, što znači da zaposlenici možda neće moći shvatiti s kim bi trebali razgovarati o projektu ili brizi. Uravnotežavanje potrebe za fleksibilnošću među odjelima s važnošću jasnog lanca zapovijedanja važan je dio organizacijske strukture.
Učinkovitost u organizaciji odnosi se na količinu posla potrebnog za postizanje ciljeva učinka. Ako je organizacija strukturirana na učinkovit način, rad će biti produktivan i koristan, s malo otpada. Učinci organizacijske strukture na učinkovitost mogu biti ogromni, budući da loše organiziran sustav može usporiti rad u gotovo svakom području tvrtke. Jedan primjer organizacijske strukture koja vodi do neučinkovitosti mogao bi biti zaposlenik koji mora proći kroz sedam razina šefova i nadzornika da bi dobio odobrenje za zadatak, njegov ili njezin rad može stagnirati satima, ako ne i danima, čekajući odobrenje. Proces prilagođavanja strukture za učinkovitost obično uključuje pojednostavljenje ili racionalizaciju zapovjednih lanaca.
Cilj većine organizacija je učinkovitost u svim područjima, uključujući odnose sa zaposlenicima, učinkovitost, prodaju i marketing. Organizacijska struktura se često naziva “kosturom” poslovanja, koji može pomoći ili spriječiti postizanje učinkovitosti. Jedan od načina na koji struktura može utjecati na učinkovitost je ugradnja procesa revizije koji provjerava očekivanja u odnosu na stvarnu učinkovitost. Stvaranjem organizacijske strukture koja se može revidirati i prilagoditi, tvrtka može kontinuirano napredovati prema ispunjavanju ciljeva učinkovitosti.