Kada je riječ o pokretanju mreže, administratori nailaze na mnoge probleme u upravljanju mrežom, olakšavajući potrebu za mrežnim politikama i strategijama. Piratstvo i hakiranje uobičajeni su problemi s vođenjem mreže, a to može znatno koštati tvrtke ako se ne drže pod kontrolom. Mnoge mreže su bežične, pa je jedan od uobičajenih problema upravljanja mrežom osiguravanje da bežične smetnje ne sprječavaju rad mreže. Mnoge mreže s vremenom postaju sve veće, pa skalabilnost postaje problem za većinu administratora. Zaposlenicima su često potrebni programi ako žele obavljati svoj posao, a instaliranje programa na svako računalo i njihovo ažuriranje može biti teško.
Hakiranje i piratstvo mogu utjecati na svakog korisnika računala, ali većina hakera češće napada poslovne mreže nego obične korisnike. To je zato što mreže obično imaju vrijedne informacije koje se mogu prodati drugim ljudima ili tvrtkama. To znači da administratori moraju stalno paziti na hakere. Dok će vatrozidi i antivirusni softver zaustaviti neke hakere, administratori će možda morati poduzeti naprednije sigurnosne mjere tijekom napada kako bi spriječili hakera da preduboko uđe u sustav.
Iako bežične mreže imaju mnoge prednosti, one su osjetljive na smetnje, što je uzrok jednog od uobičajenih problema upravljanja mrežom. Bežične smetnje mogu proizaći iz mnogih stvari, a administratori moraju dati sve od sebe da ove smetnje ne uzrokuju velike zastoje. Smetnje se ne mogu u potpunosti kontrolirati jer ih prirodni čimbenici sprječavaju, ali administratori mogu pokušati konfigurirati mreže tako da su smetnje rijetka pojava.
Uz sve više podataka i radnika potrebnih za funkcioniranje mreže, skalabilnost je jedan od najčešćih problema upravljanja mrežom. Skalabilnost uključuje potrebu za rastom mreže, što prisiljava administratore da obavljaju mnoge zadatke. Možda će biti potrebni novi poslužitelji, što bi zahtijevalo više prostora za držanje poslužitelja; poslužitelji mogu povećati operativne troškove zbog struje i topline; a ogromna količina potrebne memorije mora se pravilno održavati. Administratori imaju zadatak da upravljaju novom veličinom mreže, zajedno s povećanjem mreže na najjeftiniji način.
Instaliranje i upravljanje softverom za sva računala u mreži jedan je od problema upravljanja mrežom koji može biti vrlo zamoran. Administratori moraju proći kroz svako računalo kako bi osigurali da svako od njih ima odgovarajući softver, a također moraju ažurirati softver. Obično postoje programi koje administratori mogu koristiti za pojednostavljenje ovog zadatka, ali u nekim slučajevima i dalje može biti potrebna ručna instalacija.