Prisutnost bakterija u sjemenu smatra se normalnom u većini slučajeva, budući da se kulture prirodno nalaze unutar urinarnog i genitalnog trakta. U nekim slučajevima ova zdrava bakterija može rasti izvan kontrole, što dovodi do infekcije. Infekcija unutar penisa ili prostate može dovesti do visoke razine bakterija u sjemenu. Seks sa zaraženim partnerom također može dovesti do infekcije genitalnog ili mokraćnog sustava, iako je to manje vjerojatno.
Svi zdravi muškarci imaju određenu razinu bakterija u sjemenu. Ove uobičajene flore koloniziraju se u reproduktivnim i mokraćnim putovima i obično ne uzrokuju nikakvu štetu. Kod muškaraca koji nisu obrezani, bakterije se također mogu naseliti iza kožice. Prekomjerni rast ove bakterije može se spriječiti pravilnom higijenom. Oni koji ne peru kožicu pravilno, mogli bi završiti s infekcijom mokraćnog sustava ili više od prosječnih bakterija u sjemenu.
Kolonizacija bakterija ne smatra se infekcijom. Infekcija je obično povezana s dodatnim simptomima, poput učestalosti mokrenja ili hitnosti. Ostali znakovi infekcije uključuju groznicu, gnoj ili krv iz penisa, neobičan iscjedak ili bol. Ponekad nije poznat uzrok infekcije. Normalne bakterije mogu rasti brže nego inače iz raznih razloga, uključujući hormonalne probleme, neobičan stres ili neku drugu bolest.
Velike količine bakterija u sjemenu također mogu biti uzrokovane infekcijom kroz seks sa zaraženim partnerom. Žene s bakterijskom vaginalnom infekcijom mogu širiti štetne bakterije spolnim odnosom. To se ne smatra isto što i spolno prenosive bolesti, koje su uglavnom uzrokovane virusima. Kada se to dogodi, muškarci će obično primijetiti simptome infekcije. Liječnik je općenito onaj koji otkriva bakterije u sjemenu.
Oticanje prostate također može dovesti do infekcije jer natečena žlijezda prostate ne dopušta da se mjehur potpuno isprazni. Bakterije se tada puštaju da rastu unutar mjehura, a zatim mogu migrirati u genitalni trakt. Ovo stanje je mnogo češće kod starijih muškaraca jer su skloni povećanju prostate.
U većini slučajeva liječenje velikih količina bakterija u sjemenu uključuje korištenje antibiotskih lijekova. Točna vrsta korištenog lijeka ovisit će o vrsti prisutne bakterije. U rijetkim slučajevima, neobrezanom muškarcu može se odstraniti kožica zbog ponavljajuće infekcije ako bakterije potječu iz prekomjernog rasta ispod same kožice. Ovo je neuobičajeno kod muškaraca koji prakticiraju pravilnu higijenu. Muškarcima s povećanom prostatom često se daju lijekovi za smanjenje otekline, a također se mogu liječiti i temeljna stanja prostate.