Uzroci disleksije još nisu u potpunosti shvaćeni, ali se vjeruje da su uglavnom nasljedni. Drugi uzroci disleksije mogu uključivati oštećenje sluha u ranom djetinjstvu, što može uzrokovati da vrlo mala djeca pogrešno razumiju odgovarajuće zvukove riječi i slova. Neki stručnjaci vjeruju da se disleksija javlja zbog razlika u načinu na koji je mozak strukturiran ili funkcionira. Mozak osoba s disleksijom možda pokušava obraditi govorni i pisani jezik na desnoj strani mozga, dok mozak ljudi koji nemaju disleksiju pokušavaju obraditi jezik na lijevoj strani. Drugi vjeruju da se disleksija javlja kada se mozak kao cjelina jednostavno ne formira pravilno ili da kombinacija svih ovih čimbenika može biti odgovorna za disleksiju.
Neki stručnjaci smatraju da oštećenje sluha u vrlo male djece može uzrokovati da pate od disleksije. Argument za ovu teoriju je da ova mala djeca krivo čuju i pogrešno tumače te zvukove jezika i mogu imati problema s podudaranjem slova s njihovim ispravnim zvukovima.
Drugi vjeruju da su problemi s razvojem ili funkcioniranjem mozga među glavnim uzrocima disleksije. Neki istraživači smatraju da se mozak osoba s disleksijom jednostavno ne formira na odgovarajući način, tako da se ne stvaraju neuronske veze potrebne za normalno razumijevanje jezika. Drugi pak misle da mozak osoba s disleksijom pokušava protumačiti jezik na desnoj strani mozga. Vjeruje se da mozak normalnih ljudi tumači jezik na lijevoj strani mozga, tako da osoba koja koristi svoj desni mozak za tumačenje jezika može biti u značajnom nedostatku.
Vjeruje se da je nasljeđe jedan od primarnih uzroka disleksije. Istraživači vjeruju da kombinacija gena može biti uključena u razvoj ovog stanja. Nadalje je utvrđeno da je vrlo vjerojatno da će od njega patiti i identični blizanci ljudi s ovim stanjem. Ljudi koji imaju disleksiju obično će imati roditelja, baku i djeda, tetku, ujaka ili brata ili sestru s invaliditetom. Međutim, mnogi istraživači priznaju da su uzroci disleksije i dalje tajanstveni, te da neki ili svi od ovih čimbenika, kao i čimbenici koji još nisu identificirani, mogu biti odgovorni za stanje.