Najčešći uzroci zubobolje obično uključuju karijes, inficirane desni i prijelome. Ponekad je zubobolja zapravo posljedica upućene boli, što znači da nešto nije u redu s nekim drugim dijelom tijela, a bol se odnosi na zube. Ljudi koji pate od problema sa sinusima mogu se žaliti i na bolove u zubima jer sinusi oko jagodičnih kostiju mogu nateći i vršiti pritisak na zube i čeljusti. Iako mnogi ljudi vjeruju da su uzroci zubobolje obično povezani s karijesom, to nije uvijek točno. Karijes rijetko uzrokuje zubobolju dok ne postane toliko jak da zub počinje propadati.
Zubna bol koja je posljedica problema sa zubima obično se ne javlja dok se živci ne izlože. Karijesi su obično bezbolni sve dok zub ne istrune do te mjere da su živci vidljivi i mogu doći u dodir sa zrakom ili tvarima poput hrane. Ponekad kada se šupljine popune, plombe mogu izaći nakon nekoliko godina, što također može uzrokovati bol. U većini slučajeva, jedina stvar koja štiti živce zuba kada je ispuna kaviteta je karijes. Obično nije velika stvar ponovno napuniti kavitet ako stara ispuna ispadne.
Jedan od češćih uzroka zubobolje je infekcija desni. Postoji mnogo različitih stvari koje mogu uzrokovati inficiranje desni, a jedan od glavnih krivaca može biti zaglavljivanje hrane između zuba. Stvari koje su tvrde i hrskave, poput kokica ili čipsa od krumpira, imaju tendenciju da budu posebno loše za zaglavljivanje među zubima. Ako se nešto tvrdo i oštro zaglavi u zubima, nastavak žvakanja može dovesti do guranja unutar zubnih džepova u desni. Kada se to dogodi, desni će osobe vjerojatno nateći i doživjeti jaku bol jer se infekcija obično javlja u tom trenutku.
Prijelom zuba je još jedan čest uzrok zubobolje. Zubi se lome iz mnogo različitih razloga, ali prijelomi se često događaju zbog nesreća, kao što su padovi ili neka vrsta traume lica tupim predmetom. Kad zubi puknu, živci su obično izloženi, a to može uzrokovati mnogo boli. Za bolove u zubima često su krivi sinusi i preporučena bol, a ti problemi obično znače da sa zubima zapravo ništa nije u redu. Ako sinusi uzrokuju zubobolju, bol će obično nestati čim problem sa sinusima nestane. U slučaju upućene boli, zubobolja obično prestaje kada se otkrije izvor navedene boli i zbrine.