Candida je gljivica ili kvasac koji može rasti u crijevnoj flori crijeva zbog prekomjerne uporabe antibiotika i drugih čimbenika iz okoliša. U nekim krugovima prirodnog i alternativnog liječenja, kefir za liječenje kandide prilično je popularan za promicanje zdrave crijevne flore i za smanjenje prekomjernog rasta kvasca. Smatra se da probiotici u kefiru pomažu stabilizirati zdrave bakterije u tijelu i ubijaju sve štetne bakterije koje bi mogle izazvati infekciju. Neka istraživanja su pokazala da određena vrsta probiotičkih bakterija pomaže u smanjenju prekomjernog rasta kvasca; međutim, specifične studije o učincima kefira na kandidu su minimalne i ne sugeriraju oslanjanje na jedini tretman za ovaj poremećaj.
Budući da je kandida kategorizirana kao gljivična ili bakterijska infekcija koja uvelike naseljava crijevnu floru unutar crijeva, mnoge prirodne terapije usmjerene su na nadopunjavanje crijevne flore probioticima. Probiotici se općenito nazivaju dobrim bakterijama u crijevima, koje pomažu u jačanju imunološkog sustava i borbi protiv stranih napadača. Kefir, fermentirani napitak koji je vrlo sličan pitkom jogurtu, sadrži obilje prirodnih probiotika koji mogu promovirati te funkcije u tijelu. Smatra se da probiotici prisutni u napitku mogu pomoći u borbi protiv loših bakterija povezanih s kandidom i prekomjernim rastom gljivica.
Osim loše prehrane i općenito nezdravog načina života, prekomjerna upotreba antibiotika često je opći mehanizam zbog kojeg može doći do prekomjernog rasta kvasca. Korištenje probiotika u borbi protiv učinka antibiotika može biti od pomoći, jer će probiotici pomoći napuniti crijevnu floru novim zdravim bakterijama koje su potrebne za pravilnu podršku imunološkog sustava. Kefir za kandidu je popularan upravo iz tog razloga, jer većina kefirnih napitaka sadrži dobar izvor potrebnih probiotika. Jasno je, međutim, da se korištenje kefira za liječenje kandide ne smije koristiti kao jedini tretman, jer druge dokazane konvencionalne terapije mogu biti od još veće pomoći.
Jedan probiotski soj nazvan saccharomyces boulardii pokazao je određenu učinkovitost u smanjenju razine kandide u tijelu. To može pokazati da korištenje kefira za kandidu može biti od pomoći pružanjem ove određene vrste dobrih bakterija. Još uvijek je potrebno više istraživanja kako bi se otkrilo je li količina ovog soja bakterija u glavnim kefirnim napitcima dovoljno značajna da se bori protiv prekomjernog rasta kvasca. Smatra se da je nezaslađeni kefir najbolji izvor ovog probiotika ako se koristi za kandidu, jer šećer može hraniti kvasac i pogoršati problem.