Neki alternativni liječnici koriste izraz “alopatija” za opisivanje ljudi koji prakticiraju konvencionalnu ili “zapadnu” medicinu. Budući da je ova riječ u osnovi razvijena kao epitet za vrijeđanje tradicionalnih liječnika, rijetko se može vidjeti kako redoviti liječnici sebe nazivaju alopatima. Neki liječnici također odbijaju korištenje tog izraza jer smatraju da više nije adekvatna karakterizacija medicinske prakse.
Samuel Hahemann, utemeljitelj homeopatije, skovao je izraz “alopatija”. Potječe iz grčkih korijena, a otprilike se prevodi kao “suprotna patnja”. Koristio je tu riječ da opiše često oštre i ponekad besmislene tretmane koje su koristili konvencionalni liječnici u 19. stoljeću. Mnogi su se praktičari oslanjali na teoriju “humora” koja datira još od starih Grka, i vjerovali su da su medicinska stanja karakterizirana viškom ili manjkom određenog humora. Puštanje krvi, kupanje čaša i razne druge tehnike korištene su za uspostavljanje ravnoteže humora, a Hahemann je vjerovao da su te prakse bile barbarske.
Hahemann je također želio jasno razlikovati homeopatiju od tradicionalnije prakse medicine. Tvrdio je da alopatija uključuje liječenje simptoma bolesti, a ne temeljnog uzroka stanja. Cilj alopatskog liječenja bio je proizvesti učinke koji bi se suprotstavili simptomima, ali ne nužno da bi se došlo do korijena problema. Homeopatija je, s druge strane, bila liječenje prilagođeno pojedinom pacijentu, s fokusom na cijelo tijelo, a ne na apstraktne simptome.
Iako je praksa konvencionalne medicine nekada mogla zaslužiti oznaku alopatije, mnogi liječnici vjeruju da to više nije slučaj. Osteopatski liječnici, na primjer, prakticiraju pristup medicini cijelog tijela, a njihova uvjerenja su gotovo identična onima redovitih liječnika. Mnogi liječnici također prepoznaju važnost promatranja cijelog tijela pri procjeni zdravlja i potreba pacijenata, a moderni medicinski tretman usmjeren je na opće dobro, a ne samo na reaktivni odgovor na simptome bolesti.
Pežorativne implikacije ovog izraza ponekad se gube na ljude koji ga koriste. Neki alternativni liječnici govore o alopatiji zajedljivim tonovima kada razgovaraju s klijentima, kako bi naglasili vrijednost tretmana koje nude. Međutim, drugi praktičari alternativne medicine izbjegavaju taj izraz, shvaćajući da postoji mnogo pristupa medicini, a neki čak rade ruku pod ruku s konvencionalnim liječnicima. Kiropraktičar, na primjer, može raditi sa specijalistom za kralježnicu na liječenju i sprječavanju ozljeda leđa.