Antibakterijski šampon je vrsta deterdženta koji sadrži kemikalije koje ubijaju bakterije. Za razliku od antibakterijskog sapuna, posebno je dizajniran za korištenje na ljudskoj kosi ili životinjskom krznu. Iako su ljekovita svojstva usmjerena na kožu, svojstva čišćenja šampona su dizajnirana da djeluju na kosu i krzno. Postoji niz antibakterijskih sredstava koja se mogu koristiti u antibakterijskom šamponu, a najbolji tip šampona za korištenje ovisit će o razlogu zbog kojeg je šampon propisan.
Kao i druge vrste šampona, antibakterijski šampon je napravljen za čišćenje kose i kože ispod nje. Iako je moguće koristiti obični sapun za pranje kose, može biti teško isprati sapun, pa većina ljudi radije koristi šampone koji su posebno formulirani za čišćenje prljavštine i masnoće s kose, a zatim potpuno ispiru. U kombinaciji s antibioticima, šampon se može koristiti za čišćenje kose i za uklanjanje bakterijskih infekcija na koži.
Kod ljudi se antibakterijski šampon često koristi za liječenje akni na tjemenu. Normalno sredstvo za pranje akni napravljeno je za korištenje na koži, ali može oštetiti kosu ako se koristi na glavi. Posebno formulirani šampon protiv akni siguran je za korištenje kada pokušavate očistiti vlasište od akni. Ovi šamponi sadrže jedan ili više antibiotika, kao što su metilkloroizotiazolinon ili salicilna kiselina koja pomaže ubiti bakterije koje bi mogle ući u pore i stvoriti prištiće.
Također je moguće da ljudi koriste ovu vrstu šampona za liječenje stafilokoknih infekcija, koje se mogu pojaviti na tjemenu. U većini slučajeva, infekcije poput ovih treba liječiti oralnim antibiotikom kao i lokalnim antibakterijskim šamponom. Svaku infekciju kože trebao bi pregledati liječnik koji može odrediti najbolju vrstu antibiotika za borbu protiv infekcije.
Veterinarska medicina također koristi antibakterijske šampone, posebno u liječenju žarišta na psima. Ovisno o težini kožne infekcije, veterinar može propisati antibiotske pilule, antibiotsku mast i antibiotski šampon. Šampon pomaže u čišćenju bakterijskih infekcija koje su raširenije na koži životinje jer je lakše nanijeti antibakterijsko sredstvo po cijeloj životinji kada je kupate u šamponu s antibiotikom. Jod, benzoil peroksid i klorheksidin acetat su svi uobičajeno korišteni antibakterijski agensi u veterinarskim antibakterijskim šamponima.