Atlas anatomije je knjiga koja opisuje različite anatomske strukture i sustave tijela. Iako se ove knjige najčešće viđaju u kojima opisuju ljudsku anatomiju, moguće je pronaći i atlas koji opisuje i anatomiju životinja. Jedna od najvažnijih značajki atlasa anatomije je da pruža brojne ilustracije koje prikazuju anatomiju tako da je čitatelj može vizualno razumjeti.
Postoji niz različitih načina na koje se atlas anatomije može organizirati, ali najčešća je organizacija prema tjelesnim sustavima. Skeletni, mišićni, krvožilni, limfni, živčani i razni organski sustavi često su odvojeni kada se vizualno prikazuje ljudska anatomija. To omogućuje da se svaki sustav razumije pojedinačno, često s jednim nadogradnjom na drugi, sve dok se na kraju teksta ne prikaže potpuna slika ljudske anatomije. Drugi uobičajeni organizacijski obrazac je kroz poprečne presjeke, ili kriške, koji prikazuju kompletnu anatomiju ljudskog bića jedan po jedan tanki kriški.
Većinu vremena, atlas anatomije prikazuje samo jedan mogući prikaz ljudske anatomije. Međutim, svaka je osoba jedinstvena, što znači da dva anatomska sustava nisu potpuno slična. Moguće su brojne varijacije u ljudskoj anatomiji, a većina tih varijacija ne utječe na sposobnost tijela da funkcionira. Međutim, ozbiljne razlike u anatomiji mogu uzrokovati medicinska stanja ili bolesti. Mnoge od ovih abnormalnosti prikazane su u raznim atlasima koji prikazuju anatomske varijacije.
Stvaranje prvog atlasa anatomije bio je važan napredak u medicinskoj tehnologiji. U mnogim kulturama, seciranje ljudskih leševa je, donedavno u ljudskoj povijesti, bilo strogo zabranjeno. To je liječnicima otežalo razumijevanje što se događa unutar tijela osobe ispod kože. Iako su liječnici i znanstvenici sastavili mnoge ilustracije ljudske anatomije tijekom stoljeća, tek relativno nedavno u povijesti medicine ovi crteži su sastavljeni u temeljit i anatomski ispravan svezak.
Godine 1830. Jean Baptiste Marc Bourgery započeo je rad na jednom od najopsežnijih atlasa anatomije koji je ikada sastavljen. Blisko je surađivao s umjetnikom Nicolasom Henrijem Jacobom, a njegov atlas anatomije uključivao je 726 litografija u boji. Svaka od ilustracija u tekstu osmišljena je u prirodnoj veličini, dajući medicinskim stručnjacima jasan i točan prikaz unutrašnjosti ljudskog tijela. Završetak ovog atlasa od osam svezaka trajao je gotovo četiri desetljeća.