Bakterijska kontaminacija je situacija koja se događa kada bakterije završe na mjestu gdje ne bi trebale biti. Često se koristi za označavanje kontaminacije hrane bakterijama koje mogu uzrokovati bolest, ali se također mogu pojaviti u drugim okruženjima. Ova situacija nije poželjna, jer može predstavljati prijetnju zdravlju i uzrokovati druge probleme. Kao rezultat toga, poduzimaju se koraci kako bi se izbjegla kontaminacija u okruženjima gdje to može postati problem.
U slučaju hrane, bakterijska kontaminacija može se dogoditi u mnogim koracima duž opskrbnog lanca od proizvođača do stola za večeru. Bakterije mogu biti prisutne u vodi i tlu i jahati zajedno s usjevima. Također se mogu prenijeti od ljudi koji rukuju hranom ili ih upoznati s hranom putem prljave opreme, od onečišćene opreme za pakiranje do prljavih tava u restoranu. Kontaminacija bakterijama kod kuće često se događa kao posljedica ostavljanja hrane na pultu, neodržavanja hrane hladnom ili nepranja ruku prije rukovanja hranom. Jednom u hrani, bakterije se mogu razmnožavati, čineći skok do ljudskog domaćina kada netko pojede hranu.
Bakterijska kontaminacija također može biti problem u medicinskim klinikama, operacijskim salama i drugim zdravstvenim ustanovama. Bakterije se mogu prenijeti od pacijenata ili zdravstvenih ustanova, a mogu završiti na kirurškim instrumentima, medicinskoj opremi, kvakama na vratima i brojnim drugim mjestima. U zdravstvenim ustanovama, to je posebno velik problem jer bolesni ljudi su u opasnosti da obole ako su izloženi štetnim bakterijama.
U znanstvenim istraživanjima, bakterijska kontaminacija uzoraka može biti problem, kao i kontaminacija uzoraka uzetih na analizu od strane patologa. Prisutnost neželjenih bakterija može pokvariti eksperiment, odbaciti rezultate patologije ili jednostavno zbuniti istraživača. Bakterije se lako šire kroz laboratorije putem raznih površina, uključujući opremu koja nije pravilno sterilizirana, prljave ruke i kroz ventilacijske sustave.
Prevencija bakterijske kontaminacije može biti izazovna. Održavanje čistoće prostora i poštivanje pravilnog postupka rukovanja je veliki dio prevencije. Jednostavni koraci poput pranja ruku, umočenja cipela u antibakterijsku kupku nakon izlaska iz pacijentove sobe i nošenja rukavica za rukovanje uzorcima mogu uvelike smanjiti rizik od prijenosa bakterija s jednog mjesta na drugo. Također je važno provoditi redovita testiranja kako bi se provjerila bakterijska kontaminacija kako bi se ona mogla identificirati prije nego što nekome pozli ili izazove probleme s pokusom ili testom.