Biljni patogen je organizam koji uzrokuje bolest i napada biljke. Biljni patogeni su zanimljivi iz više razloga, od zabrinutosti zbog krhkih ekosustava do želje da se zaštiti opskrba hranom. Postoje brojne vrste patogena koji mogu ciljati biljke, uključujući viruse, bakterije, protozoe, parazite, crve i arheje. Ljudi koji proučavaju biljne patogene poznati su kao fitopatolozi ili biljni patolozi.
Biljni patogeni mogu napadati na više različitih načina. Neki koloniziraju tkivo u biljci, drugi se talože na površini biljke, a treći mogu ići na određena područja kao što su korijenje, stabljike i lišće. Patogeni obično uzrokuju probleme poput odumiranja tkiva, posmeđivanja, smanjenja plodova, problema s postavljanjem cvijeća i tako dalje. U ekstremnim slučajevima mogu ubiti biljku domaćina.
Poput patogena koji napadaju ljude, biljni patogeni su vrlo raznoliki. Biljni patogen je možda evoluirao da napadne određeni rod ili vrstu biljaka, ili da šire zarazi većinu biljaka. Neki biljni patogeni iskorištavaju prednosti specifičnih bioloških procesa koji se mogu dogoditi unutar vrsta domaćina, dok se drugi zadovoljavaju korištenjem biljaka kao doma jer imaju vrijedne resurse kao što su hranjive tvari.
U poljoprivredi, biljni patogeni svake godine uzrokuju ozbiljne štete. Nakon što je biljka napadnuta biljnim patogenom, njezini proizvodi se obično ne mogu prodati. Ulaganje u biljku je zbog patogena beskorisno, a obično su veliki troškovi uključeni u iskorjenjivanje patogena s polja i rješavanje ostalih ispada od zaraze. U nekim slučajevima, polje postaje toliko bolesno da se mora ostaviti da leži nekoliko godina kako bi se oporavilo prije nego što se ponovno pokuša uzgajati usjevi.
Biljni patogen također može biti zabrinjavajući kada se slučajno uveze ili namjerno unese u ranjivi ekosustav. Neki otočni narodi su posebno zabrinuti za to, jer imaju jedinstvenu floru koju bi mogao desetkovati uneseni patogen s kopna. Patogeni također mogu biti problem kada se šire između okruga; na primjer, patogen koji napada grožđe i ograničen je na Europu može predstavljati veliku prijetnju ako dospije u vinarije u Australiji, koje možda nisu spremne upravljati patogenom.
Ekolozi su zainteresirani za proučavanje patogena koji mogu zaraziti biljke, promatrajući njihov učinak na različite vrste i ekosustave. Kada biljke dožive odumiranje i druge probleme, često je uzrok biljni patogen, pa se može pozvati patolog da otkrije koji je patogen odgovoran i razvije plan za njegovo suzbijanje.