Cisterna magna, otvor u subarahnoidnoj šupljini u mozgu, nazvana je tako zbog svoje velike veličine. Zapravo, to je najveći od otvora koji se mogu naći u ovoj praznini središnjeg živčanog sustava. Cisterna magna je također poznata kao cerebelomedularna cisterna.
Alternativni naziv cisterne magna, cerebelomedularna cisterna, izveden je iz mjesta otvora. Proteže se duž malog mozga, dijela mozga koji je odgovoran za nečiju koordinaciju pokreta, kao i za doprinos drugim funkcijama kao što su budnost, govor i reakcija na emocije poput straha i radosti. Također se nalazi blizu gornje površine duguljaste moždine. Ovo je donji dio stražnjeg dijela mozga koji se naziva moždano deblo, koji omogućuje funkcije kao što su disanje, krvni tlak, brzina otkucaja srca i disanja te seksualno uzbuđenje.
Subarahnoidna šupljina, gdje se nalazi cisterna magna, također je poznata kao subarahnoidalni prostor. Stvara prostor između arahnoidne materije i jabučice. To su membrane koje predstavljaju dvije od tri moždane ovojnice koje pokrivaju središnji živčani sustav, točnije mozak i leđnu moždinu. Arahnoid je dobio ime po svom obliku koji podsjeća na paukovu mrežu.
Treća membrana koja prekriva središnji živčani sustav, dura mater, nalazi se na vrhu arahnoida i pia mater kao najudaljenijeg sloja sustava. Okružujući mozak i leđnu moždinu, zadržava bistru, bezbojnu tekućinu koja se naziva cerebrospinalna tekućina ili liquor cerebrospinalis. Proizvodi se u horoidnom pleksusu i izlijeva se u cistern magna iz lateralnih i srednjih otvora jedne od šupljina ispunjenih tekućinom mozga, koje se nazivaju četvrti ventrikul. Infiltriranjem u cisternu između nekoliko drugih regija, likvor djeluje kao plutajući i zaštitni uređaj za cijeli mozak.
Uz cisternu magnu nalazi se još nekoliko otvora, od kojih su svi manji. U subarahnoidnom prostoru mogu se naći i pontinska cisterna i interpedunkularna cisterna. Prva sadrži krvnu žilu zvanu Basilar arterija, koja opskrbljuje oksigeniziranu krv u mozgu, dok je druga dobila ime po svom omotaču struktura nalik stabljikama u velikom mozgu, nazvanih cerebralne pedunke. Druge značajne cisterne osim cisterne magne uključuju gornju cisternu, koja sadrži veliku krvnu žilu poznatu kao velika cerebralna vena; i ambijentalni vodokotlić, koji se može smatrati produžetkom spomenutog otvora.