Pojam digitalni mikroskop može se odnositi na dvije različite postavke. To može biti optički mikroskop s priključenom video kamerom ili digitalnom kamerom ili mikroskop s integriranom kamerom. U oba slučaja, sposoban je prikazati prikaz onoga što je na pozornici kao digitalnu sliku, au oba slučaja kamera se može nazvati digitalnom mikroskopskom kamerom. Digitalna mikroskopska kamera pričvršćena na optički mikroskop ima nedostatak što su leće dizajnirane za ljudsko oko, a ne za kameru, pa slika može biti slabije kvalitete od one dobivene integriranim modelom. S druge strane, neki integrirani modeli nemaju okular i ovise o povećanju s monitora.
Digitalna mikroskopska kamera omogućuje niz mogućnosti koje nisu dostupne kod mikroskopa koji nema takvu kameru. Omogućuje pohranjivanje slika za vođenje evidencije, prijenos preko Interneta ili ugradnju u dokumente. Projicirana slika omogućuje proučavanje izvan mikroskopa i dijeljenje slike s drugima – na primjer, grupom učenika ili kolega, a povećanje također može dovesti do boljeg razumijevanja podataka. Uz video kameru dodaje se mogućnost snimanja i dijeljenja pogleda na fenomen ili eksperiment tijekom vremena.
Postoje monokularni optički mikroskopi i trinokularni mikroskopi koji su dizajnirani da olakšaju pričvršćivanje digitalne mikroskopske kamere ili video kamere. U slučaju monokularnog mikroskopa, digitalni fotoaparat stane preko jednog okulara. Uz trinokularni mikroskop, kamera se pričvršćuje na treći okular, koji je posebno dizajniran za ovu namjenu. Prilikom dodavanja digitalne mikroskopske kamere na mikroskop, C-mount adapter za mikroskop je uobičajeni konektor.
Prvi digitalni mikroskop napravio je Hirox® 1986. USB i FireWire sada omogućuju izravne veze između kamere digitalnog mikroskopa i računala. Ostale važne razlike u postavkama digitalnog mikroskopa uključuju kvalitetu optike, dostupnost okulara, broj megapiksela koje kamera ima, softver koji se koristi, je li mikroskop na postolju ili ručni, te cijenu .