Pedijatrijska gastroenterologija proučava bolesti koje zahvaćaju gastrointestinalni trakt i jetru posebno djece. Mišići probavnog trakta i sustava za odlaganje otpada ljudskog tijela s vremenom se postupno razvijaju, te mogu doživjeti kvarove i manje smetnje dok su još nedovoljno razvijeni, kao što je to slučaj u djece. Refluks, probavne smetnje i proljev česti su simptomi koji se manifestiraju kod mladih ljudi koji boluju od ozbiljnije gastrointestinalne bolesti. Liječnici koji su zainteresirani za ovo područje medicine mogli bi htjeti stažirati s gastroenterolozima praktičarima slijedeći njihove programe specijalizacije kako bi naučili specifične načine na koje te različite bolesti mogu utjecati i oštetiti tijela dojenčadi, male djece i adolescenata.
Gastroezofagealni refluks jedna je od najčešćih tegoba koje liječe dječji gastroenterologi. Ovo je regurgitacija dijela probave hrane iz želuca. Mnogi ljudi obično doživljavaju ovaj simptom u manjoj mjeri na dnevnoj bazi, često nakon velikih i teških obroka, bez dugotrajnih negativnih nuspojava. Međutim, kada se javlja prečesto kod djece, može imati štetne posljedice. Dojenčad i mala djeca koja ispljunu većinu svoje hrane nakon svakog obroka mogu pretrpjeti oštećenje jednjaka, ne udebljati se na odgovarajući način i na kraju mogu imati problema s disanjem, ako se ne liječe.
Starija djeca mogu se uputiti na posjet pedijatrijskoj gastroenterološkoj ordinaciji ako njihov opći pedijatar vjeruje da možda imaju intoleranciju na laktozu, sindrom iritabilnog crijeva, Crohnovu bolest ili pretjeranu dijareju. Intolerancija na laktozu je nemogućnost podnošenja mlijeka u probavnom sustavu. Sindrom iritabilnog crijeva je iritacija sluznice želuca i tankog crijeva zbog čega probava postaje teška i neugodna. Crohnova bolest je pogoršanje ovoga i uključuje i debelo crijevo, iako je vrlo rijetka. Ove bolesti obično zahtijevaju stručnost izvan liječnika opće prakse, a često se mogu liječiti specijaliziranim lijekovima i promijenjenom prehranom koji su poznatiji gastroenterologu.
Studenti medicine zainteresirani za studij pedijatrijske gastroenterologije mogu zatražiti pripravnički staž u trenutnoj klinici koja je usmjerena na liječenje gastrointestinalnih poremećaja u djece. Mnoge takve klinike nude mentorski program koji studentima omogućuje da prate iskusne liječnike dok se sastaju s pacijentima tijekom dana. Ova stažiranja često dovode do zaposlenja s punim radnim vremenom za sudionike nakon završetka njihovih medicinskih diploma i studija.