DNA gel elektroforeza je proces koji se koristi za odvajanje proteina i nukleinskih kiselina u molekularnoj biologiji. Gel se obično sastoji od umreženog polimera i akrilamida koji pomažu u odvajanju i analizi različitih dijelova molekule DNA. DNA gel elektroforeza se obično koristi u forenzici za određivanje specifičnog slijeda DNK kako bi se pronašao glavni osumnjičenik. Također se često koristi u genetici i poljima molekularne biologije i biokemije.
Nukleinske kiseline i proteini nose ili pozitivan ili negativan naboj. Kada se stavi u električnu komoru u DNA gel elektroforezi, svaki električni naboj će se kretati prema oba kraja komore. Negativno električno nabijene molekule kretat će se na pozitivan kraj komore, dok će se pozitivno električno nabijene molekule kretati prema negativnom kraju. Gel odvaja svaku od ovih molekula tako da se ravnomjerno rašire tijekom očitanja. Gel se sastoji od dugih vlakana koja sprječavaju pomicanje molekula kako bi pomogli u analizi pojedinačnih molekula.
Southern blotting je tehnika koja se koristi u DNA gel elektroforezi za određivanje prisutnosti ili odsutnosti specifične nukleotidne sekvence u molekuli DNA. Northern blotting je drugačija tehnika koja se koristi za identifikaciju ekspresije gena u prisutnosti RNA ili ribonukleinske kiseline. Eastern blotting se koristi za određivanje prisutnosti lipida, proteina i ugljikohidrata u sekvenci DNK. Za jednostavno otkrivanje proteina u sekvenci DNK, tehnika western blottinga koristi se u komori za elektroforezu kroz izolaciju gela.
Zimografija je također pristup otkrivanju određenih bioloških funkcija putem DNA gel elektroforeze. Uglavnom se koristi za proučavanje enzima koji razgrađuju ekstracelularni matriks, koji kataliziraju uništavanje matriksa izvan stanice, kao i bazalne membrane stanice. Korištenje poliakrilamidnog gela pomaže u odvajanju enzima, koji su proteini, korištenjem proteinskog supstrata kao što je želatina ili kazein. Ova tehnika se koristi za mjerenje količine aktivnosti razgradnje koja se događa izvan stanice.
DNA gel elektroforeza se vrlo često koristi u forenzici. Koristi se za odvajanje krvnih proteina i DNK pronađenih na mjestu zločina kako bi se utvrdile korelacije s dostupnim osumnjičenicima. Gel elektroforeza se također koristi za određivanje specifičnog nasljeđa unutar genetike, budući da su određeni DNK i proteini povezani s različitim rasama. Također se koristi za rješavanje slučajeva očinstva kako bi se utvrdio relativni odnos između pojedinaca.