Funkcionalna neurokirurgija je kirurška specijalnost usmjerena na liječenje pacijenata koji dožive abnormalnosti u funkciji središnjeg živčanog sustava bez poremećaja fizičkih struktura u mozgu i leđnoj moždini. Ovi pacijenti imaju anatomiju koja se čini normalnom, ali imaju problema s kretanjem, percepcijom i drugim zadacima koji uključuju središnji živčani sustav. Osobe koje rade u ovom području završavaju specijalizaciju iz neurokirurgije i mogu dobiti stipendije za dodatnu obuku.
Funkcionalne neurokirurgije liječe se niz vrsta stanja. Jedna je epilepsija, gdje aktivnost napadaja u mozgu uzrokuje fizičke i neurološke simptome poput trzanja i gubitka pamćenja. Ponekad je moguće izolirati i ablairati područje mozga u kojem nastaju napadaji, čime se sprječava ponovna pojava napadaja. Postupci poput prekida corpus callosum, veze između dviju polovica mozga, također su opcija za liječenje pacijenata s epilepsijom koja ne reagira na konzervativnije mogućnosti liječenja.
Poremećaji kretanja poput Parkinsonove bolesti također se mogu liječiti funkcionalnom neurokirurgijom. Ponekad će kirurški zahvat poremetiti oštećeni dio mozga riješiti karakteristične drhtanje povezane s tim stanjem i pomoći pacijentu da uživa u normalnijem životu. Kronična bol može se kontrolirati uz pomoć funkcionalne neurokirurgije kako bi se poremetili poremećeni signali boli koje šalju zbunjeni neuroni, a ova kirurška specijalnost također može biti uključena u upravljanje određenim vrstama psihijatrijskih poremećaja.
U funkcionalnoj neurokirurgiji, liječnik se oslanja na vrlo precizno poznavanje opće anatomije mozga, uz pomoć detaljnih slikovnih skeniranja mozga pacijenta. Ove informacije omogućuju liječniku da cilja na željeno područje mozga uz minimalno oštećenje susjednog tkiva. Mozak je pretrpano okruženje, a pogreška može rezultirati trajnim neurološkim problemima za pacijenta, u rasponu od poteškoća s finom motoričkom kontrolom do nejasnog govora.
Postoji niz pristupa funkcionalnoj neurokirurgiji, uključujući radiokirurgiju, gdje se pacijentova lubanja zapravo nikada ne otvara. Umjesto toga, zračenje se usmjerava u mozak kako bi pogodilo mjesto namijenjeno ablaciji. Zračenje oštećuje stanice u toj regiji mozga, rješavajući problem povezan s abnormalnom funkcijom stanica. Kirurzi također koriste tehnike poput laserskog vođenja, gdje se konstruira trodimenzionalno skeniranje mozga i koristi za razvoj skupa koordinata koje se mogu programirati u kirurške alate kako bi kirurg došao do pravog mjesta. Ozlijeđena područja mozga možda nisu uvijek vidljiva pri fizičkom pregledu, a korištenje rezultata funkcionalnih slikovnih studija za određivanje područja interesa može rezultirati boljim kirurškim ishodima.