Interakcija proteina je biološki proces koji uključuje spajanje dvaju ili više proteina. Ove proteinske veze bitan su dio staničnih funkcija svih živih organizama i često su potrebne da bi proteini ispunili svoje specifične funkcije. Ove stanične operacije uključuju kritične procese kao što je replikacija DNK koja je olakšana složenim molekularnim strukturama koje proizlaze iz interakcija proteina. Ovaj proces također čini srž mnogih staničnog posredovanja i signalnih funkcija. Proteinske veze mogu imati različite oblike uključujući dugotrajne kompleksne veze i kratkoročne odnose proteinskog transporta ili modifikacije proteina.
Proteini su prirodni spojevi koji se sastoje od linearnog rasporeda aminokiselina. Ti su spojevi dio najosnovnijih i najbitnijih bioloških građevnih blokova za sva živa bića. Ovi građevni blokovi obavljaju bezbroj kritičnih funkcija na staničnoj razini, bilo sami ili kao dijelovi većih vezanih proteinskih skupina. Općenito poznati kao kompleksi, vezani spojevi formirani ovom interakcijom proteina odgovorni su za širok raspon kritičnih staničnih funkcija kao što su replikacija DNA, međustanična signalizacija, modifikacija proteina i transport. Proučavanje mehanike vezanja proteina također stalno poboljšava sposobnost istraživača da razumiju i bore se protiv mnogih bolesti koje i dalje muče čovječanstvo.
Jedna od najznačajnijih funkcija interakcije proteina je transdukcija signala. Kemijski signali koji potječu izvan stanice često su posredovani ili se prenose u unutrašnjost putem mehanike protein/protein kompleksa. Ovi prijenosi signala ključni su za mnoge stanične procese i igraju važnu ulogu u napredovanju bolesti kao što je rak. Neke proteinske interakcijske veze imaju transportnu ulogu s jednim proteinom olakšavajući kretanje drugog izvan stanice u jezgru. Obrnuto je i u slučaju nuklearnih pora, tj. velikih proteinskih kompleksa koji se kreću iz središta stanice prema van putem učinaka interakcije proteina.
Još jedna od mnogih bitnih funkcija proteinske interakcije je proces modifikacije proteina kinaze. Ovaj proces uključuje dodavanje nekoliko fosfatnih skupina jednom proteinu drugom u kompleksu. Ovi modificirani spojevi također igraju vitalnu ulogu u posredovanju međustaničnog signala s otprilike 30 posto svih ljudskih proteina modificirano kinazom temeljenom na interakciji proteina. To su kratkoročne interakcije koje ponekad traju samo nanosekunde da se završe. Ostali procesi vezanja proteina su po prirodi dugotrajniji, a za neke je potrebno nekoliko sati ili čak dana.