Plaćanje za nedostatak izravna je potpora za kompenzaciju poljoprivrednicima za razliku između zajamčene cijene i stvarne tržišne vrijednosti robe. Takva su plaćanja dostupna proizvođačima ograničenog broja roba u nekim zemljama. Oni osiguravaju da poljoprivrednici nastave proizvoditi usjeve od ključne važnosti čak i kada tržišna cijena padne, jer im je zajamčena osnovna cijena. To čini izvedivim nastavak proizvodnje umjesto zamjene usjeva profitabilnijom alternativom. Pružanje plaćanja manjka može biti donekle kontroverzno u nekim regijama.
Prema ovom sustavu, vlada stvara popis roba za koje vjeruje da su važne, poput kukuruza, pšenice i riže. Utvrđuje osnovnu zajamčenu cijenu, temeljenu na tržišnim čimbenicima i drugim uvjetima. Kada je usjev spreman za tržište, ako poljoprivrednici ne mogu dobiti tu cijenu, mogu podnijeti zahtjev za isplatu manjka. Time im se nadoknađuje razlika između stvarne prodajne vrijednosti uroda i koliko bi zaradili da su dobili zajamčenu cijenu.
Neke vlade također daju privremene zajmove u vrijeme žetve. To omogućuje poljoprivrednicima da zadrže vlasništvo nad usjevom dovoljno dugo da dopuste da se cijene vrate s niskih vrijednosti koje se obično razvijaju kada je tržište preplavljeno dok poljoprivrednici donose žetvu. To se često financira kroz program plaćanja manjka ili je usko povezano. Pruža poticaj poljoprivrednicima da nastave uzgajati usjeve obuhvaćene programom, kako bi se osigurala dostupnost za širu javnost.
Da bi primio isplatu manjka, poljoprivrednik obično mora zadovoljiti neke standarde. To uključuje dokaz da je usjev proizveden, s dokumentacijom o prodajnoj cijeni i okolnostima prodaje. Osim toga, poljoprivrednici će možda morati dokazati da poštuju propise o zaštiti okoliša i da na odgovarajući način štite svoje radnike. Poljoprivrednici koji su kažnjeni za onečišćenje i druga kršenja zakona mogu izgubiti pravo na primanje plaćanja, jer vlada ne želi poticati nesigurne ili nepraktične poljoprivredne aktivnosti.
Točna struktura programa plaćanja manjka može ovisiti o politikama koje su uspostavili regulatori i zakonodavci. Povremeno, zakonodavna tijela razmatraju nove zakone o poljoprivrednim gospodarstvima, pakete zakona koji pokrivaju različite teme vezane uz poljoprivredu. Oni mogu odrediti koje vrste financijske pomoći ponuditi poljoprivrednicima i kako upravljati tim programima kako bi bili učinkoviti i funkcionirali. Informacije su dostupne poljoprivrednicima i poljoprivrednim tvrtkama putem istih vladinih agencija koje upravljaju programom.