Filter u kanisteru je veliki, moćni filter za akvarij koji se koristi za mehaničku, biološku i po izboru, kemijsku filtraciju. Filtri za kanister nalaze se ispod spremnika, obično unutar postolja za akvarij. Oni su zatvoreni cilindri koji stoje oko 15″ (38 cm) visoki, s poklopcima za zaključavanje. Poklopci imaju usisne i izlazne ventile koji se spajaju na cijev, koja se dovodi u spremnik. Usisna cijev uvlači vodu u filtar gdje slijedi kružni put kroz različite filtarske medije prije nego što se izbaci na izlaznom ventilu kako bi se vratila u spremnik.
Kanisterski filteri su izuzetno robusni. Za razliku od filtara na spremniku, filteri za kanister mogu normalno trajati nekoliko mjeseci bez ikakvog održavanja.
Unutrašnjost filtera za kanister varira ovisno o proizvođaču i modelu. Međutim, svi obavljaju iste osnovne funkcije. Voda ulazi u filter kroz poklopac koji drži motor s magnetskim rotorom. Voda prolazi kroz velike pjenaste jastučiće dizajnirane da zarobe čestice. Zatim slijedi put kroz niz komora ispunjenih raznim filterskim medijima koji pročišćavaju vodu u većim stupnjevima u svakom koraku. Konačno, voda prolazi kroz medij koji je dizajniran da sadrži kolonije bakterija koje čine biološki filter. Sada je pročišćena voda spremna za povratak u spremnik. Na površini spremnika gdje se nalazi odvodna cijev, prirubnica se dovodi za usmjeravanje struje. Alternativno se može pričvrstiti šipka za prskanje.
Održavanje filtera kanistera je jednostavno. Cijeli proces traje oko 15 minuta i obično se izvodi samo 1-3 puta godišnje. Budući da filteri u spremniku zahtijevaju tako malo održavanja, kemijska filtracija se umjesto toga često prebacuje na filtar spremnika. Na taj način, ugljik ili specijalne smole koje se sastoje od kemijske filtracije mogu se lako mijenjati koliko god je potrebno, jednostavnim posezanjem u filtar za vješanje, umjesto ometanjem spremnika.
Kanisterski filteri dolaze u različitim veličinama s odgovarajućim brzinama protoka. Iako je filtar kanistera previše za spremnik od 10 galona (38 litara), skromni filter za kanister na spremniku od 20 – 30 galona (75 – 113 litara) bi bio u redu, iako ovisno o vrsti ribe, možda biste trebali odbiti struju ili koristiti raspršivač. I naravno, kanisterski filteri izvrstan su izbor za srednje do velike spremnike, osim ako se ne želi korita. U tom slučaju bi se koristio mokri/suhi filtar, čime bi kanisterski filter bio nepotreban.
Uz svu svoju snagu, kanisterski filteri su praktički tihi i troše vrlo malo električne energije. Motori s magnetskim impelerom, koji se također koriste za vješanje na filtere spremnika i pogonske glave, iznimno su pouzdani i mogu trajati više od desetljeća. Bez obzira što vaše filtriranje treba, osim vrlo malog akvarija, filtar u kanisteru zasigurno će biti jedno od najboljih ulaganja koje možete napraviti u ovom vrlo isplativom hobiju.