Stanice imunološkog sustava, kao što su T stanice i B stanice, na svojoj površini imaju proteine koji im omogućuju da prepoznaju strane napadače i napadaju ih. Područja ovih proteina mogu varirati od stanice do stanice, što im omogućuje da reagiraju na razne prijetnje. Povremeno se proizvode T stanice i B stanice koje reagiraju na proteine koje eksprimiraju vlastite stanice tijela, zvane autoantigeni. Klonsko brisanje je proces koji omogućuje neutralizaciju tih stanica prije nego što se puste u tijelo, gdje bi potencijalno mogle početi napadati zdravo tkivo.
T stanice se proizvode u koštanoj srži, ali sazrijevaju u timusu, žlijezdi blizu srca, a B stanice se proizvode u koštanoj srži. Unatoč različitim mjestima podrijetla, obje ove vrste stanica koriste sličnu metodu klonske delecije kako bi osigurale da se zrele imunološke stanice koje reagiraju na autoantigene ne puštaju u krvotok. Tijekom procesa sazrijevanja, ove stanice dolaze u kontakt s ograničenim rasponom stanica, kao što su makrofagi i dendritske stanice timusa. Ove stanice imaju razne površinske proteine, zvane antigeni, koje prezentiraju imunološkim stanicama, tako da se one stanice koje proizvode reakciju mogu iskorijeniti.
Da bismo koristili timus kao primjer, dendritične stanice timusa koriste proces prezentacije, dopuštajući T stanicama da pokušaju vezati površinske proteine, kako bi ih pregledali na klonsko brisanje. Nezrele T stanice koje reagiraju na ove autoantigene tvore proteinski kompleks sa stanicom timusa. U slučaju da se ovaj proteinski kompleks formira, on pokreće sekvencu samouništenja, zvanu apoptoza, u T stanici, tako da ona ne sazrije i ne uđe u tijelo, gdje bi potencijalno mogla pokrenuti štetni odgovor ako naiđe na drugu stanicu s taj protein.
Tijelo sadrži mnoge druge vrste stanica osim onih koje se mogu vidjeti u timusu i koštanoj srži, tako da klonsko brisanje mora uzeti u obzir autoantigene koji se inače ne nalaze u tim tkivima. Timus to čini tako što ima dendritske stanice timusa koje sadrže površinske proteine koji se obično nalaze drugdje, kao što je tkivo gušterače. Tada se može dogoditi klonska delecija kod imunoloških stanica koje bi normalno reagirale na te proteine gušterače, a sličan proces regulira sazrijevanje B stanica u srži. Neka bolesna stanja, kao što je dijabetes, mogu biti djelomično uzrokovana neuspjehom tijela da predstavi cijeli niz tjelesnih antigena zrelim imunološkim stanicama, dopuštajući tim stanicama sazrijevanje i napad na zdravo tkivo.