Što je koncentracija RNA?

Koncentracija ribonukleinske kiseline (RNA) mjera je koliko je ovog genetskog materijala prisutno u uzorku. Ova nukleinska kiselina jedan je od važnih građevnih blokova života, kritična za funkcioniranje organizama od kitova do kućnih mačaka. Može se analizirati u testiranju iz raznih razloga, uključujući dijagnostičke svrhe, istraživanje i forenzičku analizu. Prije nego što se može testirati, potrebno ga je pažljivo obraditi i provjeriti kako bi se potvrdilo da je uzorak dobrog integriteta i da će dati točne rezultate.

Prilikom obrade, tehničari izdvajaju RNA iz uzorka kako bi ga mogli analizirati. To može uključivati ​​liječenje enzimima koji uklanjaju deoksiribonukleinsku kiselinu (DNA) i proteine ​​koji mogu biti prisutni u uzorku. Potrebne su pažljive kontrole kako bi se ograničile šanse za kontaminaciju i sačuvala što je više moguće RNA. Za ovaj se proces može koristiti specijalizirano stakleno posuđe i laboratorijska plastika, a tehničari također slijede standardni laboratorijski postupak za dosljednost.

Klasični pristup mjerenju koncentracije RNA uključuje provođenje uzorka kroz spektrofotometar, uređaj koji mjeri apsorpciju svjetlosti. Očitavanja mogu pružiti informacije o tome koliko je RNK prisutno na temelju toga koliko je svjetlosti u određenim valnim duljinama apsorbirano. To također može ukazivati ​​na to da li su kontaminanti prisutni u uzorku, jer drugi materijali apsorbiraju svjetlost različitih valnih duljina. Dakle, test može imati dvostruku funkciju kvantificiranjem RNA i procjenom kontaminacije.

Druga mogućnost je dodati boju uzorku i izložiti ga svjetlu da se vidi fluorescira li boja i koliko intenzivno. Boje se mogu čvrsto vezati za nukleinske kiseline kako bi pružile informacije o njihovim koncentracijama. Jedna mana ove metode je da vrijednosti koncentracije RNA mogu biti pogrešne ako uzorak također sadrži DNA ili druge nečistoće, jer se boja također može vezati na njih. Tehničari mogu koristiti ovu opciju za određivanje koncentracije RNA samo ako su uvjereni da je uzorak vrlo čist kako bi izbjegli dobivanje lažnih rezultata.

Ako je koncentracija RNA preniska, uzorak možda neće biti upotrebljiv. Možda neće biti dovoljno za pokretanje testova i dvostruku provjeru rezultata, na primjer. Povećana mogućnost pogreške također može biti zabrinjavajuća, jer bi se problemi s uzorkom povećali ako je dostupna samo ograničena količina RNA. Tehničar će možda morati pročistiti novu seriju ili zatražiti svježi uzorak, ako je to opcija, kako bi utvrdio je li moguće dobiti čišći uzorak s višom koncentracijom RNA.