Liječenje fibroidne ciste ovisi o težini simptoma, kao io tome želi li oboljela žena sačuvati plodnost. Hormonska nadomjesna terapija često je prva linija liječenja, iako je često potrebna kirurška intervencija. Histerektomija, odnosno potpuno uklanjanje maternice, najčešći je tip operacije za fibroidnu cistu, iako to čini ženu trajno neplodnom. Miomektomija se može izvesti ako žena želi očuvati plodnost i uključuje uklanjanje mioma, a da se maternica ostane netaknuta. O svim pitanjima ili nedoumicama o najprikladnijim opcijama liječenja fibroidnih cista u pojedinoj situaciji treba razgovarati s liječnikom ili drugim medicinskim stručnjakom.
Hormonska nadomjesna terapija je standardna metoda liječenja kada se otkrije fibroidna cista. Neki hormoni mogu pomoći u smanjenju veličine fibroida, dok drugi mogu pomoći u smanjenju nekih bolnih simptoma povezanih s tim cistama. Lijekovi protiv bolova koji se mogu kupiti bez recepta, kao što je ibuprofen, također se mogu pokazati korisnima u kontroli boli i nelagode.
Kirurški zahvat poznat kao miomektomija može se koristiti za uklanjanje fibroidne ciste kako bi se pokušala očuvati plodnost. Ovaj postupak je osmišljen za uklanjanje ciste, a da se maternica ostane netaknuta. Otprilike polovica žena koje se podvrgnu ovoj vrsti operacije morat će ponoviti zahvat u roku od pet godina zbog visoke stope recidiva. Zbog toga se miomektomija smatra privremenim rješenjem.
Laserska ablacija je vrsta zahvata koji služi za smanjenje veličine fibroidne ciste, čime se smanjuje jačina boli i drugih simptoma uzrokovanih rastom. Jezgra fibroida se spaljuje u nadi da će tumor umrijeti. Šanse za recidiv su relativno visoke i za ovaj zahvat. Embolizacija fibroida uključuje korištenje malog katetera za blokiranje protoka krvi u fibroid, iako stopa recidiva još nije poznata kada se koristi ova relativno sada opcija liječenja.
Jedini pravi lijek za fibroidne ciste je vrsta operacije poznata kao histerektomija. Ovaj postupak uključuje potpuno uklanjanje maternice, čime se pacijentica šalje u neposrednu menopauzu i završava plodnost. Bez maternice miomi nemaju gdje rasti, pa nema šanse da se ponovno pojave. Jajnici se mogu, ali i ne moraju ukloniti tijekom operacije, ovisno o opsegu oštećenja i bilo kojim drugim osnovnim zdravstvenim stanjima.