Liječenje intraduktalnog papiloma ovisi o brojnim čimbenicima, uključujući ozbiljnost simptoma i cjelokupno zdravlje pacijenta. Lijekovi protiv bolova koji se mogu kupiti bez recepta i korištenje toplih obloga često se mogu koristiti za kontrolu svake nelagode uzrokovane ovim stanjem. Ponekad mogu biti potrebni jači lijekovi protiv bolova, a često je potrebna i kirurška intervencija. Kirurške opcije uključuju biopsiju ili uklanjanje papiloma i svih zahvaćenih kanala unutar dojke. O svim pitanjima ili nedoumicama o najprikladnijem liječenju intraduktalnog papiloma za pojedinačnu situaciju treba razgovarati s liječnikom ili drugim medicinskim stručnjakom.
Iako je kirurgija standardna metoda liječenja intraduktalnog papiloma, manje invazivne mjere mogu se koristiti u početnim fazama kako bi se kontrolirala bol i upala. Topli oblozi mogu se stavljati na zahvaćenu dojku nekoliko puta dnevno kako bi se smanjila nelagoda. Lijekovi bez recepta kao što su aspirin i ibuprofen mogu smanjiti količinu prisutne upale, kao i pomoći u kontroli blage do umjerene boli. Ako lijekovi koji se izdaju bez recepta ne daju dovoljno olakšanja, mogu se propisati jači lijekovi protiv bolova. Ovi lijekovi su namijenjeni za kratkotrajnu primjenu zbog mogućih nuspojava i komplikacija pri dugotrajnoj primjeni.
Postoji nekoliko različitih postupaka biopsije za liječenje intraduktalnog papiloma. Biopsija jezgre, također se naziva biopsija iglom, minimalno je invazivan postupak i uključuje korištenje igle za dobivanje uzorka tkiva za daljnje ispitivanje. Primarni razlog za ovu vrstu biopsije je utvrditi postoje li prisutne stanice raka kako bi se mogao razviti detaljniji program liječenja.
Biopsija potpomognuta vakuumom zahtijeva vrlo mali rez i koristi opremu za snimanje za vođenje kirurga dok se mala količina tkiva uklanja iz intraduktalnog papiloma. Ekscizijska biopsija je nešto invazivnija i omogućuje kirurgu da u svrhu usporedbe ukloni više abnormalnog tkiva kao i uzorak zdravog okolnog tkiva. Ova vrsta biopsije može se izvesti samostalno ili tijekom operacije za uklanjanje samog intraduktalnog papiloma.
U većini slučajeva liječenje intraduktalnog papiloma uključuje kirurško uklanjanje izrasline kao i svih zahvaćenih kanala. Ova se operacija obično izvodi ambulantno, iako se ponekad preporuča boravak u bolnici preko noći kako bi se pacijent mogao nadzirati na bilo kakve znakove potencijalnih komplikacija. Stopa recidiva je relativno niska, iako nadzorni liječnik može naručiti periodične pretrage kako bi se uvjerio da se intraduktalni papiloma nije vratio.