Smješten duboko u središtu mozga, lijevi i desni bazalni gangliji okružuju talamus i čine kritični dio prednjeg mozga. Vjeruje se da su ovi ganglije simetrične strukture i funkcije. Iako je znanje o moždanim poremećajima koji utječu na lijeve bazalne ganglije u izobilju, konačna, koherentna teorija o njihovoj funkciji tek se treba pojaviti. Smatra se da je ova regija mozga uključena u izvršne funkcije, učenje i emocije. Eksperimentalne studije su pokazale da je ova ganglija uključena u odabir aktivnosti, promjenu aktivnosti i kretanje, ali ostaje nejasno kako koristi svoju inhibitornu aktivnost za aktiviranje motornih neurona.
Najčešći poremećaji koji utječu na lijeve bazalne ganglije su Huntingtonova bolest i Parkinsonova bolest. Oba ova stanja karakteriziraju abnormalnosti pokreta, kao i pad kognitivne fleksibilnosti i izvršne funkcije. To daje vjerodostojnost teoriji da je ova regija mozga odgovorna za raznolik i složen niz zadataka u mozgu.
Touretteov sindrom i opsesivno-kompulzivni poremećaj također su povezani s disfunkcijom lijevih bazalnih ganglija. To nije iznenađujuće, jer mnogi neuroznanstvenici sumnjaju da bi promjena aktivnosti i selekcija također mogli biti posredovani ovim dijelom mozga. Nalazi da bi ovisnost mogla biti posredovana u ovoj regiji daju dodatnu podršku teoriji da ovaj ganglija regulira motivaciju i učenje o ponašanju.
To bi moglo pomoći objasniti važnost ove regije u mozgu kralježnjaka. Svaka vrsta kralježnjaka ima barem rudimentarne elemente lijevih bazalnih ganglija. To ukazuje da će vjerojatno igrati važnu ulogu u kretanju, ponašanju i primitivnim motivacijskim impulsima.
Neki stručnjaci vjeruju da upotreba inhibitornog neurotransmitera gama-aminomaslačne kiseline (GABA) lijevog bazalnog ganglija u većini neurona umjesto stimulirajućeg neurotransmitera glutamata dodatno otežava razumijevanje njegove funkcije. Ti neuroni ostvaruju svoju aktivnost tako što inhibiraju djelovanje svojih meta, tako da postoji bezbroj mogućnosti za poništavanje njihovih znakova utjecaja. To stvara mogućnost za još više teorija o tome koje neuronske skupine rade zajedno kako bi postigle svoje učinke.
Unatoč važnosti GABA-e u ganglijama kao cjelini, jedan od njegovih odjeljaka ima visoku koncentraciju kolinergičkih neurona. Stanice unutar striatuma, iako čine samo mali dio ovog ganglija u cjelini, gotovo isključivo koriste ekscitatorni neurotransmiter acetilkolin. Značajna količina neurona u regiji također koristi dopamin. Ovo je neurotransmiter za koji se smatra da umiruje motivaciju i ovisnost, kao i da igra ulogu u napredovanju Parkinsonove bolesti, pa se njegova važnost za cjelokupnu funkciju lijevih bazalnih ganglija ne može precijeniti.