Kirurški zahvat marsupijalizacije uključuje stvaranje trajnog izlaza do ciste. Brz i relativno jednostavan postupak, zahvat često zahtijeva samo lokalnu anesteziju. Zahvat uključuje urezani otvor koji se drži otvorenim šavovima. Ciste Bartholin žlijezda, osobito se obično liječe metodom marsupijalizacije.
Ciste se razvijaju u žlijezdama ako je blokiran normalan izlaz tekućine iz žlijezde. To povećava veličinu kanala i žlijezde jer se tekućina koju izlučuje žlijezda, poput sebuma, zadržava i nakuplja iza blokade. Postupak uključuje stvaranje novog, trajnog izlaza za tekućinu.
Primjer stanja koje se često liječi marsupijalizacijom je cista Bartholinove žlijezde u rodnici. Te se žlijezde nalaze s obje strane unutarnjih usana rodnice. Obično se ne mogu napipati, ali ciste žlijezda mogu narasti do 3 cm (1.2 inča).
Prvo se napravi rez koji reže vanjsku kožu i unutarnji zid ciste. To omogućuje bijeg unutarnje tekućine. Zatim se klin mesa odsiječe u ovalnom obliku od zida ciste i kože iznad.
Kako bi spriječio da posjek zacijeli natrag preko ciste i da se ponovi, liječnik mora učiniti otvor trajnim. To se postiže preklapanjem strana reza i šivanjem na okolnu kožu kako bi se stvorio otvor za žlijezdu. Ako liječnik jednostavno probije jednu od ovih cista tako što napravi rez koji nije zašiven, cista se može ponoviti.
S marsupijalizacijom, cista se obično ne zatvara natrag. Šavovi na bočnim stranama reza mogu biti izrađeni od biološki apsorbirajućeg materijala, koji nije potrebno skidati. Kako vrijeme prolazi i rez zacjeljuje, strane rane postaju sve manje i zategnutije.
Ovaj oblik operacije obično zahtijeva samo lokalnu anesteziju na to područje umjesto opće anestezije. U slučaju ciste Bartholinove žlijezde liječnik je može obaviti u ordinaciji opće prakse, a cijeli zahvat traje svega 15-ak minuta. Bolnice također mogu provoditi zahvate marsupijalizacije. Ovaj oblik liječenja ciste može biti prvi koji se izvodi, ili se može koristiti kao sekundarni tretman gdje druge tehnike nisu djelotvorne. Sličan zahvat, nazvan operacija prozora, novija je tehnika od marsupijalizacije koja uključuje veći rez s manjim rizikom od začepljenja.