Postoje dvije najčešće korištene vrste maskara — vodootporna maskara ili maskara na bazi ulja je dugotrajna i otporna na mrlje, dok se maskara na bazi vode lakše nanosi i uklanja. Jedna od najvećih prednosti maskare na bazi vode je njezin prirodni potencijal razine vodika (pH), što je čini zdravijom opcijom za korištenje u blizini nježne kože oko očiju. Također ne sadrži neke od kemikalija i aditiva koji se nalaze u vodootpornoj maskari, što maskaru na bazi vode čini idealnim izborom za one koji imaju osjetljive oči ili su alergične na kožu. Treća vrsta maskare je miješana maskara, iako se ne koristi tako često. Mješovita maskara je kombinacija maskare na bazi vode i vodootporne maskare, a s objema dijeli mnoge prednosti i nedostatke.
Dugi niz godina vodootporna maskara bila je popularnija od vodene. Vodootporna maskara traje dulje, pa se ne mora tako često nanositi. Ova vrsta maskare se ne razmazuje tako lako, što znači da će preživjeti suze, znojenje, pa čak i snažno plivanje. Maskara za produljenje i zgušnjavanje često je na bazi ulja. Također, mnogi smatraju potrebnim koristiti tri ili četiri sloja vodene varijante kako bi dobili isti učinak koji pružaju samo jedan ili dva sloja maskare na bazi ulja.
Korištenje maskare na bazi vode ima mnoge prednosti. Iako se vodootporna maskara ne razmazuje i traje dulje, također ju je mnogo teže ukloniti. Za ovu vrstu šminke potrebni su oštriji skidači maskare, koji mogu štetiti trepavicama.
Maskare na bazi vode mnogo je lakše ukloniti nježnijim sredstvom za uklanjanje maskare ili čak sapunom i vodom. Maskara na bazi vode suši se brže i neće uzrokovati zgrušavanje ili lijepljenje trepavica kao maskara na bazi ulja. Oni s alergijama na koži ili osjetljivim očima često se potiču da koriste maskaru na bazi vode. Vodootporna maskara često sadrži tvari poput naftnih destilata koje mogu uzrokovati iritaciju ili izbijanje.
Maskara na bazi vode idealna je za one koji traže prirodne alternative za šminkanje očiju. Osobe koje nose kontakt trebaju odabrati maskaru na bazi vode koja je hipoalergena ili s oznakom “za osjetljive oči”. Za one s ekstenzijama trepavica, korištenje na bazi ulja moglo bi otopiti vezivna sredstva koja se koriste za pričvršćivanje ekstenzija na trepavice. Ti bi potrošači trebali odabrati maskaru koja nije samo na bazi vode, već je napravljena posebno za one s ekstenzijama. Svatko tko želi narasti dužim i gušćim trepavicama treba izbjegavati korištenje maskare na bazi ulja, jer skidanje vodootporne maskare može oštetiti trepavice na način da onemogućuje njihov rast po želji.