Što je Microarray?

Mikroniz je slijed točaka DNK, proteina ili tkiva raspoređenih na niz za jednostavnu istovremenu analizu. Najpoznatiji je DNA mikromrež, koji igra važnu ulogu u profiliranju genske ekspresije. Materijal podloge je staklo, plastika ili silikonski čip. Alternativni nazivi za DNK mikroniz uključuju genski čip, DNA čip i biočip. Mali dijelovi DNK nazivaju se sonde.

Mikroniz se može napraviti na razne načine. Najprimitivnije je jednostavno baciti DNK na staklena stakla pomoću pribadača. Sofisticiranije tehnike koriste fotolitografiju, elektrokemijske pristupe, pa čak i inkjet ispis — sve što može točno dostaviti DNK na točno određeno mjesto.

DNK mikromreža je proizvod kasnih 1980-ih i ranih 1990-ih, kada je biotehnologija zaista počela rasti. Mikromaterija omogućuje istraživaču da izvede niz testova na svim uzorcima u isto vrijeme, dramatično ubrzavajući istraživanje. Tradicionalno biološko eksperimentiranje djeluje na stvari jednu po jednu. Sonde su ponekad označene točkama koje se nazivaju fluorofore kada se ne mogu lako razdvojiti.

Neki od najvećih mikronizova, koje su izradile tvrtke kao što je NimbleGen Systems, sadrže čak 390,000 točaka. Mikroniz se često koristi u analizi cjelokupnog genoma organizma, koji može sadržavati desetke ili više kromosoma, svaki sa svojom DNK i RNK. Nažalost, nisu svi mikronizovi međusobno kompatibilni i postoji očit nedostatak standarda. Napori na standardizaciji su u tijeku, ali za sada bez većeg uspjeha.

Kao i većina najsuvremenijih biotehnoloških istraživačkih programa, testovi na mikromrežu mogu proizvesti ogromne količine podataka, što dovodi do područja bioinformatike, koja nastoji dati smisao svemu tome. Možda postoje otkrića i korelacije koje smo već izmjerili, ali jednostavno nismo primijetili zbog prelijevanja podataka. Data mining se intenzivno koristi za analizu rezultata ovih složenih eksperimenata.