Mikrobna patogeneza je proces kojim mikroorganizam uzrokuje bolest. Mikroorganizmi sposobni za mikrobnu patogenezu uključuju bakterije, gljive i viruse. Oblici tih organizama koji uzrokuju bolesti nazivaju se patogeni. Mikrobna patogeneza prati podrijetlo i uzrok bolesti, kako se manifestira u tijelu i kako tijelo reagira na nju.
Postoje četiri glavne vrste patogeneze u ljudskom tijelu. Upala je oticanje tkiva u tijelu dok se problem rješava i zamjenjuje zaraženo tkivo. Malignost je abnormalni razvoj reprodukcije stanica kao što se često nalazi kod karcinoma. Slom ili nekroza tkiva je smrt stanica izvan normalnog staničnog ciklusa. Infekcija nastaje kada su stanice inficirane bakterijama, virusima gljivičnih spora.
Infekcije su najvjerojatniji oblik mikrobne patogeneze, iako se upale mogu pojaviti kao nusprodukt infekcije. Svaka takva infekcija može se podijeliti u tri široke kategorije. Akutna infekcija je relativno kratka, konačna i s brzim početkom. Kronična infekcija je dugotrajnija i teško se nosi s njom. Ponavljajuća infekcija može imati brz ili spor početak, ali će nestati kao da je izliječena samo da bi se vratila kasnije.
Svaka infekcija putem mikrobne patogeneze odvija se u tri široka stadija. To su početna infekcija, razmnožavanje i nastavak vrste. Posljednja dva su glavni razlozi svake infekcije. Mikroorganizmu je potreban veći organizam kao što je čovjek kako bi se razmnožavao i širio. Umnožavanje ili replikacija često se odvija unutar ćelije.
Cilj za mikroorganizam nakon što se sam počeo razmnožavati je izbaciti svoje verzije iz tijela prije nego što ga tjelesne snage samoobrane unište. Tijelo obično reagira mješavinom bijelih krvnih stanica, također zvanih makrofagi, i antitijela. Mikroorganizam će, dakle, pokušati izaći iz tijela kako bi zarazio nekoga čiji imunološki sustav nije podešen da ga odmah odbije.
To znači da su početna faza infekcije i konačna faza prijenosa neizbrisivo povezane – postoje četiri glavna načina za prijenos mikrobne patogeneze s jedne osobe na drugu. Prvi je kroz aerosole kao što su kapljice vode kod kašlja i kihanja. Drugi je putem gutanja ili putem fekalne tvari. Treći se prenosi vektorima, kao i druge životinje kao što su komarci i krpelji. Četvrti glavni put je izmjena tjelesnih tekućina tijekom seksa, transfuzije krvi i ljubljenja.
Uspjeh infekcije ovisi i o mnogim čimbenicima. Priroda mikroorganizma i način na koji se replicira je jedan od čimbenika. Drugi je imunološki status zaražene osobe. Ako je pojedinac već imao kontakt s mikroorganizmom, velike su šanse da će tijelo biti dobro pripremljeno da ga odbije.