Ekologija močvarnih staništa uključuje proučavanje bilo kojeg područja zemljišta koje je djelomično ili potpuno potopljeno ispod vode, bilo trajno ili na duži vremenski period svake godine. Postoje mnoge vrste močvara, u rasponu od močvara do obalnih plimnih močvara. Svaki okoliš sadrži jedinstvenu mješavinu biljaka i životinja.
Proučavanje močvara velika je grana ekologije močvara. Močvare su uglavnom definirane prisutnošću potopljenih, ali još uvijek živih stabala. Ova područja općenito postoje na poplavnim ravnicama u blizini rijeka i mogu postati prilično velika. Močvarni sustav Al-Sudd u južnom Sudanu, na primjer, pokriva preko 30,000 četvornih kilometara (18,641 četvornu milju). U Sjedinjenim Državama, močvara Big Cypress, koja se nalazi uz Florida Everglades, sadrži 2,400 četvornih milja (3,862 četvorna kilometra) močvarne ekologije.
Močvare imaju veliku bioraznolikost. Veliki gmazovi, kao što su aligatori i krokodili, izgledaju posebno kao kod kuće u ovim područjima. Život kukaca obiluje i osigurava hranu za brojne vrste riba i ptica. Stagnirajući bazeni unutar ovih ekosustava ugošćuju razne vodene biljke i gljive.
Močvare često graniče s močvarama, ali se mogu formirati i samostalno. Ova područja mogu se sastojati od slatke vode ili kombinacije slatke i slane vode. Općenito, vode u močvarama su stajaće od močvara, a drveća je malo ili nimalo.
Područja močvarnih područja koja graniče s oceanom često sadrže mješavinu slatke i slane vode. Bočate močvare i slane močvare imaju najveći sadržaj soli, a često i najmanju raznolikost divljih životinja. U tim ekosustavima uspijevaju trave otporne na sol, poput trave kamenica i žičane trave. Rakovi, kamenice i ribe koje su nanijele plime i oseke privlače bezbroj ptica.
Slatkovodne močvare i srednje močvare imaju blag ili nikakav sadržaj slane vode. Kao rezultat toga, biljni i životinjski svijet je bogat i raznolik. Sisavci, posebice glodavci, obiluju ovim područjima. Vodene ptice, kao što su patke i guske, sveprisutne su kao i mali gmazovi poput žaba i kornjača. Ekologija močvara u močvarama također uključuje mnoge iste vrste riba i ptica koje su prisutne u lokalnim vodenim putovima.
Ekologija močvarnih staništa također, u manjoj mjeri, uključuje proučavanje močvarnih staništa. Slično kao i močvare, ove močvare su često pošumljene. Međutim, močvarna je voda izrazito kisela i obično prilično stajaća. Ova kombinacija često proizvodi treset kada su prisutne velike količine mrtve mahovine ili lišajeva.
Životinjski život unutar močvara ograničen je kiselošću vode. Međutim, prisutne su vrste često vrlo prilagođene uvjetima močvarnog okoliša. Zbog toga se ove biljke i životinje rijetko nalaze u drugim područjima.