Mullerov kanal je kanal ili cijev koja je prisutna u ljudskom embriju. Ovaj kanal se proteže niz strane strukture poznate kao urogenitalni greben, strukture koja se kasnije razvija kako bi pomogla u formiranju vanjskih genitalija, a završava na Mullerovom uzvišenju, strukturi koja pomaže u formiranju mokraćnih i genitalnih organa. Zanimljivo je napomenuti da se Mullerov kanal u potpunosti razvija samo kod ženki, pomažući u formiranju ženskog reproduktivnog sustava. Ako embrij postane muški, ti kanali se gube.
Dok je ženski embrij u fazi razvoja, postoje dvije odvojene strukture koje će se razviti kako bi jedna drugoj pomagale u formiranju reproduktivnog sustava. Jedna od tih struktura je sam Mullerov kanal, a druga se zove urogenitalni sinus. Urogenitalni sinus na kraju evoluira u mokraćni mjehur i pomaže u formiranju drugih dijelova mokraćnog i reproduktivnog sustava.
Mullerov kanal je prisutan u embriju oba spola. U ženki će se ovaj par kanala razviti u organe razmnožavanja. Kod muškaraca će ti kanali nestati. Međutim, susjedni kanali, poznati kao Wolffovi kanali, će se razviti i pomoći u formiranju muških reproduktivnih organa.
Kemikalija poznata kao anti-Müllerian hormon kontrolira razvoj Mullerovog kanala samom prisutnošću ili odsutnošću ovog hormona, koji se prvenstveno stvara u testisima muških embrija. Poremećaji u proizvodnji ovog hormona, a posljedično i Mullerovog kanala, mogu dovesti do zdravstvenih problema, ovisno o prirodi poremećaja.
Sindrom perzistentnog Müllerovog kanala stanje je u kojem Mullerov kanal ne nestaje u muškom embriju. Umjesto toga, prisutna je maternica ili drugi derivat ovog kanala. Kod ljudi je najčešći uzrok ovog sindroma genetski poremećaj ili mutacija. Operacija uklanjanja ženskih organa ili tkiva općenito se izvodi u nadi da će se očuvati muške reproduktivne sposobnosti.
Müllerova ageneza je još jedno medicinsko stanje koje se može pojaviti zbog abnormalnosti u hormonima odgovornim za razvoj Mullerovog kanala. Kod ovog stanja u ženki nedostaje maternica, a obično postoje razne vrste malformacija rodnice. Operacija je opcija kako bi se omogućio ugodan spolni odnos. Međutim, trenutno ne postoji način da se omogući plodnost ženki s ovim stanjem. Savjetovanje se često predlaže onima koji pate od ovog poremećaja.