Povijest homeopatije može se pratiti do 1779. godine, kada je dr. Samuel Hahnemann stekao medicinsku diplomu i počeo eksperimentirati s razrijeđenim tvarima za liječenje bolesti. Ovaj njemački liječnik razvio je “zakon sličnosti”, koji je ostao temeljna premisa kroz cijelu povijest homeopatije. Da bi liječenje bilo učinkovito, mora proizvesti simptome same bolesti, teoretizirao je Hahemann tijekom svojih 50 godina bavljenja homeopatskom medicinom.
Homeopatija je evoluirala iz tipičnih tretmana korištenih u kasnom 18. stoljeću, koji je bio prepun praznovjerja o tome zašto su ljudi oboljeli. Liječnici tog doba koristili su povraćanje, klistire, puštanje krvi i ljekovito bilje da oslobode tijelo od bolesti. Mnogi pacijenti su se pogoršali i umrli od ovih tretmana.
Dr. Hahnemann se zainteresirao za povijest homeopatije dok je prevodio drugu doktorsku tezu na njemački. Eksperimentirao je s razrjeđenjima kore cinkone, prihvaćenog liječenja malarije u to vrijeme. Nakon nekoliko dana, Hahnemann je dobio bol i groznicu, što se smatra ranim znakovima upozorenja malarije. Zaključio je da lijek mora izazvati simptome bolesti prije nego što postane učinkovit. Neki liječnici su osudili ove teorije, uključujući američkog liječnika i autora Olivera Wendella Holmesa.
Hahnemannova otkrića dovela su do otvaranja stotina homeopatskih bolnica i škola diljem svijeta. Homeopatija je stekla popularnost jer je manje ljudi umrlo od ovih manje toksičnih lijekova. U ovom trenutku u povijesti homeopatije, tradicionalni liječnici još uvijek su bili usredotočeni na proučavanje bolesti i mogućnosti izlječenja.
Početkom 20. stoljeća pojavila su se otkrića o tome kako klice doprinose bolesti. Zanimanje za homeopatiju počelo je slabiti i škole u kojima se podučava ovaj oblik medicine počele su se zatvarati. Oživljavanje uporabe homeopatije pojavilo se 1970-ih kada su se ljudi zainteresirali za holistički pristup bolesti.
Moderne homeopatske prakse koriste više od 3,000 lijekova za različite bolesti. Homeopatija definira lijek kao korištenje određene tvari za liječenje bolesti, što se razlikuje od tradicionalnog značenja korištenja lijeka za liječenje bolesti. Tvari mogu potjecati iz biljaka, minerala, životinja i sintetičkih proizvoda koji su jako razrijeđeni. Neki liječnici propisuju bolesne tjelesne tekućine, uključujući krv, urin i izmet u malim dozama, koje se nazivaju nozodi. Drugi homeopatski tretmani koriste sakupljenu kišnicu kao lijek.
U Indiji povijest homeopatije seže do 1835. godine, kada je rumunjski liječnik John Martin Honigberger pozvan da liječi utjecajnog maharadžu zbog oteklina stopala i paraliziranih glasnica. Maharadža je bio izliječen i toliko impresioniran da je naručio homeopatiju za konja koji je patio od čira na nozi. Doktor Honigberger je kasnije postao poznat kao stručnjak za liječenje kolere u Indiji.