Prirodni nadomjesni hormoni estrogena alternativna su hormonska nadomjesna terapija za žene koje prolaze kroz menopauzu. Tijekom menopauze tijelo proizvodi puno manju količinu estrogena i progesterona, a žena više nema menstrualni ciklus jer su joj jajnici prestali mjesečno otpuštati jajašca. Prirodna nadomjesna terapija estrogenom sastoji se od konzumiranja proizvoda i namirnica koje stimuliraju ili imaju visoku razinu fitoestrogena. Dostupna je kemijska nadomjesna terapija estrogenom, ali postoje studije koje su pokazale da te kemikalije uvelike povećavaju šanse žene za razvoj raka dojke, pa mnoge žene traže prirodne alternative kemijskoj hormonskoj nadomjesnoj terapiji.
Proizvodi od soje iznimno su bogati izoflavonima, grupom namirnica koje sadrže fitoestrogen. Tofu, edamame, sojino mlijeko i suplementi su najpopularniji izvori hrane koji sadrže velike količine zrna soje. Konzumacija zrna soje od strane žena u menopauzi bila je predmet mnogih studija, a utvrđeno je da smanjuje nuspojave menopauze uz povećanje mineralne gustoće kostiju kod žena.
Linagani su također bogati kemikalijama sličnim estrogenu. Sjemenke lana, sjemenke sezama, kruh s više žitarica i sjemenke suncokreta sadrže veliku količinu linagana. Mnogi od ovih izvora hrane također su antioksidansi i proizvode omega-3 masne kiseline kada se konzumiraju, što može pomoći u sprječavanju razvoja drugih zdravstvenih stanja. Laneno sjeme i ulje sjemenki lana mogu pomoći u smanjenju simptoma menopauze, uključujući pojavu valova vrućine ili noćnog znojenja.
Dong quai je biljni dodatak koji sadrži veliku količinu fitoestrogena. Također poznat kao angelica sinensis ili dang gui, dong quai regulira tjelesnu proizvodnju estrogena i drugih hormona kod žena bilo koje dobi, a tijekom menopauze, kada je razina estrogena kod žena niska, ova biljka će potaknuti proizvodnju estrogena u tijelu. Dong quai ima mnoge druge zdravstvene prednosti, a ponekad se koristi i za liječenje hipertenzije. Ovaj biljni dodatak može se naći u obliku kapsula, a dostupni su i čajevi koji sadrže dong quai.
Crvena djetelina je još jedna vrsta prirodne zamjenske biljke za estrogen bogata izoflavonima i linaganima, a proizvodi kemikalije koje utječu na receptore estrogena u ženskom tijelu. Ova biljka proizvodi kemikalije koje djeluju poput estrogena i smanjuju pojavu valunga i noćnog znojenja kod žena tijekom menopauze. Dodaci crvene djeteline dostupni su u kapsulama, tinkturama, a također i u prahu. Žene bi se trebale posavjetovati s liječnikom kada razmišljaju o uzimanju prirodnih suplemenata estrogena tijekom menopauze.