El Salvadorska verzija quesadille zove se pupusa, koja se pravi od tijesta na bazi kukuruza ili brašna. Jedno od najpopularnijih jela u ovoj srednjoameričkoj zemlji, pupusas može imati obilan i aromatičan punč. Poput svog meksičkog rođaka, sadrži bilo koji broj sastojaka, od sira i mesa do graha i povrća.
Arheološki dokazi upućuju na najmanje 2,000 godina proizvodnje pupusa u El Salvadoru. Počevši od autohtonog plemena Pipil, jelo je doživjelo ponovno oživljavanje popularnosti tijekom širenja predgrađa u drugoj polovici 20. stoljeća. Godine 2011. pupusarije su raspršene srednjoameričkim krajolikom i mogu se naći široko rasute po nekoliko velikih gradova u inozemstvu – osobito u Sjedinjenim Državama, gdje su mnogi El Salvadorci imigrirali tijekom građanskog rata 1980-ih.
Pupusa se pravi tako da se mali krug tijesta uvalja na dlan jedne ruke. Tradicionalno se koristi ili rižino brašno ili kukuruzno brašno poznato kao masa de maiz. Zatim se prstima druge ruke napravi džepić s krugom u koji ide sir i drugi nadjevi. Mnogi El Salvadorci za to koriste lokalni sir, nazvan quesillo. Tijesto se zatim nježno omota oko otvora džepa i zatvori, često premazanim žumanjkom. Škare se koriste za podrezivanje dodatnog tijesta, a pupusa se stisne između ruku kako bi se napravio masni, ravni disk.
Nadjev koji prati sir, ako ga ima, stvara se od jednog ili više tradicionalnih sastojaka. Pržene mahune prilično su uobičajene, kao i svinjetina ili piletina, pečena na žaru ili pržena u dubokom prženju. Chicharron – pržena svinjska kora – također je popularna stavka. Raspon kulinarskih mogućnosti je širok, uključujući školjke, pirjano povrće i domaće začinsko bilje poput cilantra ili paprike.
Pupusa je manja verzija euroazijskog tonskog kruha, koji potječe prije pet tisućljeća u naciji Gruzije. Ipak, ti se kruhovi obično peku na žaru u tonskoj pećnici u stilu tandoor. Pupusa se, međutim, može napraviti na tavi ili na roštilju s ravnim vrhom.
Nekoliko srednjoameričkih zemalja poput Hondurasa i Gvatemale usvojilo je nacionalno jelo El Salvadora. Pupusa može varirati u obliku ili sadržaju u različitim regijama, ali koncept ostaje isti. 2011. godine uobičajeno je da se ovo jelo jede ručno, umačući ga u često začinjenu kiselu slasticu zvanu curtido i u umak na bazi rajčice.