Refugium je odjeljak izoliran od ostatka populacije akvarija koji može biti unutar ili izvan akvarija. Svrha refugija, kao što bi njegovo ime sugerira, je pružiti utočište ribama i ostalim vodenim organizmima. Refugium, međutim, dijeli iste vodene uvjete kao i ostatak akvarija, što ga čini idealnom značajkom ako je cilj na kraju pustiti izolirane vrste u glavni spremnik.
Refugium može biti od koristi ako je vrsta vodenog svijeta, kao što je riba, ozlijeđena i možda treba posebnu zaštitu od agresivnih vrsta u akvariju. Često je ozlijeđena riba glavna meta napada. Najbolji način da ove ribe sačuvate dok se oporavljaju jest da ih držite izoliranim. Za neke vlasnike akvarija to je vrlo važno, jer neke egzotične vrste riba mogu biti prilično skupe.
Refugium se također može koristiti za izolaciju plijena sve dok ne bude spreman da bude predstavljen ribljoj populaciji za konzumaciju. To omogućuje plijen da se privikne na vodu; neke ribe koje preskoče ovaj proces privikavanja su šokirane kada uđu u vodu i prerano uginu. Ovo možda ne zvuči kao problem jer će plijen ionako biti pojeden, ali neke vrste riba koje su posebno prilagođene za grabež neće jesti vrste plijena koji su već mrtvi. Stoga, u nekim slučajevima, refugium može biti vrlo važan za cjelokupno zdravlje akvarija.
Refugiumi se razlikuju od većine drugih akvarijskih pregrada i separatora. Međutim, u uobičajenom narodnom jeziku, neki koriste izraz za označavanje bilo kojeg razdjelnika ili separatora uključenog u akvarij. Ipak, većina refugija se smatra takvim samo ako imaju zaseban odjeljak koji se nalazi izvan glavnog akvarija.
Uz akvarijske primjene, refugiumi se mogu koristiti i u akvakulturi. U takvim situacijama, sve jedinice utočišta dijelit će isti protok vode, ali svaka refugija može učiniti nešto malo drugačije s tom vodom. Na primjer, u nekim slučajevima, određene vrste mogu trebati sporiju struju. Druge vrste mogu trebati bržu struju. Refugiumi mogu pomoći da se to regulira. Treba napomenuti da se refugijumi često koriste za biljni i životinjski svijet.